Protein–RNA interactions for Protein: Q9D071

Mms19, MMS19 nucleotide excision repair protein homolog, mousemouse

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Length 1,031 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mms19Q9D071 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Mms19Q9D071 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Mms19Q9D071 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Mms19Q9D071 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Mms19Q9D071 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Mms19Q9D071 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Mms19Q9D071 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Mms19Q9D071 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
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Mms19Q9D071 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Mms19Q9D071 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Mms19Q9D071 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Mms19Q9D071 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Mms19Q9D071 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Mms19Q9D071 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Mms19Q9D071 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Mms19Q9D071 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Mms19Q9D071 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Mms19Q9D071 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Mms19Q9D071 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Mms19Q9D071 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Mms19Q9D071 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Mms19Q9D071 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Mms19Q9D071 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Mms19Q9D071 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Mms19Q9D071 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Mms19Q9D071 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Mms19Q9D071 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Mms19Q9D071 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Mms19Q9D071 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Mms19Q9D071 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Mms19Q9D071 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
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Mms19Q9D071 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Mms19Q9D071 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
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Mms19Q9D071 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Mms19Q9D071 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Mms19Q9D071 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
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Mms19Q9D071 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Mms19Q9D071 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Mms19Q9D071 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
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Mms19Q9D071 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Mms19Q9D071 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Mms19Q9D071 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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Mms19Q9D071 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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Mms19Q9D071 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Mms19Q9D071 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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Mms19Q9D071 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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Mms19Q9D071 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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Mms19Q9D071 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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Mms19Q9D071 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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Mms19Q9D071 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Mms19Q9D071 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Mms19Q9D071 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Mms19Q9D071 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Mms19Q9D071 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Mms19Q9D071 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Mms19Q9D071 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Mms19Q9D071 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Mms19Q9D071 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Mms19Q9D071 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Mms19Q9D071 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Mms19Q9D071 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Mms19Q9D071 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Mms19Q9D071 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Mms19Q9D071 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Mms19Q9D071 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Mms19Q9D071 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
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