Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZN4

Shisa9, Protein shisa-9, mousemouse

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Length 424 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shisa9Q9CZN4 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Shisa9Q9CZN4 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Shisa9Q9CZN4 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Shisa9Q9CZN4 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Shisa9Q9CZN4 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Shisa9Q9CZN4 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Shisa9Q9CZN4 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Shisa9Q9CZN4 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Shisa9Q9CZN4 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Shisa9Q9CZN4 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Shisa9Q9CZN4 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Shisa9Q9CZN4 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Shisa9Q9CZN4 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Shisa9Q9CZN4 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Shisa9Q9CZN4 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Shisa9Q9CZN4 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Shisa9Q9CZN4 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Shisa9Q9CZN4 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Shisa9Q9CZN4 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Shisa9Q9CZN4 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Shisa9Q9CZN4 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Shisa9Q9CZN4 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Shisa9Q9CZN4 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Shisa9Q9CZN4 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Shisa9Q9CZN4 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Shisa9Q9CZN4 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Shisa9Q9CZN4 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Shisa9Q9CZN4 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Shisa9Q9CZN4 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Shisa9Q9CZN4 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Shisa9Q9CZN4 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Shisa9Q9CZN4 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Shisa9Q9CZN4 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Shisa9Q9CZN4 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Shisa9Q9CZN4 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Shisa9Q9CZN4 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Shisa9Q9CZN4 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Shisa9Q9CZN4 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Shisa9Q9CZN4 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Shisa9Q9CZN4 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Shisa9Q9CZN4 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Shisa9Q9CZN4 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Shisa9Q9CZN4 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Shisa9Q9CZN4 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Shisa9Q9CZN4 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Shisa9Q9CZN4 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Shisa9Q9CZN4 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Shisa9Q9CZN4 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Shisa9Q9CZN4 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Shisa9Q9CZN4 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Shisa9Q9CZN4 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Shisa9Q9CZN4 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Shisa9Q9CZN4 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Shisa9Q9CZN4 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Shisa9Q9CZN4 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Shisa9Q9CZN4 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Shisa9Q9CZN4 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Shisa9Q9CZN4 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Shisa9Q9CZN4 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Shisa9Q9CZN4 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Shisa9Q9CZN4 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Shisa9Q9CZN4 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Shisa9Q9CZN4 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Shisa9Q9CZN4 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Shisa9Q9CZN4 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Shisa9Q9CZN4 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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Shisa9Q9CZN4 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Shisa9Q9CZN4 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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Shisa9Q9CZN4 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Shisa9Q9CZN4 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Shisa9Q9CZN4 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Shisa9Q9CZN4 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Shisa9Q9CZN4 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Shisa9Q9CZN4 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Shisa9Q9CZN4 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Shisa9Q9CZN4 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Shisa9Q9CZN4 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Shisa9Q9CZN4 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Shisa9Q9CZN4 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Shisa9Q9CZN4 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Shisa9Q9CZN4 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Shisa9Q9CZN4 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Shisa9Q9CZN4 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Shisa9Q9CZN4 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Shisa9Q9CZN4 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Shisa9Q9CZN4 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Shisa9Q9CZN4 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Shisa9Q9CZN4 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Shisa9Q9CZN4 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Shisa9Q9CZN4 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Shisa9Q9CZN4 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Shisa9Q9CZN4 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Shisa9Q9CZN4 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Shisa9Q9CZN4 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Shisa9Q9CZN4 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Shisa9Q9CZN4 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Shisa9Q9CZN4 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Shisa9Q9CZN4 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
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