Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZJ6

Mis18a, Protein Mis18-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 204 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mis18aQ9CZJ6 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mis18aQ9CZJ6 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mis18aQ9CZJ6 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mis18aQ9CZJ6 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mis18aQ9CZJ6 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mis18aQ9CZJ6 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mis18aQ9CZJ6 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mis18aQ9CZJ6 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mis18aQ9CZJ6 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mis18aQ9CZJ6 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mis18aQ9CZJ6 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mis18aQ9CZJ6 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Mis18aQ9CZJ6 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mis18aQ9CZJ6 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mis18aQ9CZJ6 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Mis18aQ9CZJ6 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Mis18aQ9CZJ6 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Mis18aQ9CZJ6 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Mis18aQ9CZJ6 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mis18aQ9CZJ6 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Mis18aQ9CZJ6 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mis18aQ9CZJ6 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Mis18aQ9CZJ6 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Mis18aQ9CZJ6 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mis18aQ9CZJ6 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Mis18aQ9CZJ6 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mis18aQ9CZJ6 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Mis18aQ9CZJ6 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mis18aQ9CZJ6 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Mis18aQ9CZJ6 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mis18aQ9CZJ6 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Mis18aQ9CZJ6 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mis18aQ9CZJ6 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mis18aQ9CZJ6 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Mis18aQ9CZJ6 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mis18aQ9CZJ6 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mis18aQ9CZJ6 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Mis18aQ9CZJ6 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Mis18aQ9CZJ6 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Mis18aQ9CZJ6 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Mis18aQ9CZJ6 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
Mis18aQ9CZJ6 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Mis18aQ9CZJ6 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Mis18aQ9CZJ6 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Mis18aQ9CZJ6 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Mis18aQ9CZJ6 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Mis18aQ9CZJ6 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Mis18aQ9CZJ6 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Mis18aQ9CZJ6 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mis18aQ9CZJ6 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mis18aQ9CZJ6 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Mis18aQ9CZJ6 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mis18aQ9CZJ6 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mis18aQ9CZJ6 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mis18aQ9CZJ6 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Mis18aQ9CZJ6 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mis18aQ9CZJ6 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mis18aQ9CZJ6 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Mis18aQ9CZJ6 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Mis18aQ9CZJ6 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Mis18aQ9CZJ6 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mis18aQ9CZJ6 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mis18aQ9CZJ6 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Mis18aQ9CZJ6 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Mis18aQ9CZJ6 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mis18aQ9CZJ6 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mis18aQ9CZJ6 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mis18aQ9CZJ6 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mis18aQ9CZJ6 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Mis18aQ9CZJ6 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mis18aQ9CZJ6 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Mis18aQ9CZJ6 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Mis18aQ9CZJ6 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mis18aQ9CZJ6 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mis18aQ9CZJ6 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Mis18aQ9CZJ6 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mis18aQ9CZJ6 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mis18aQ9CZJ6 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mis18aQ9CZJ6 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mis18aQ9CZJ6 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mis18aQ9CZJ6 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mis18aQ9CZJ6 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mis18aQ9CZJ6 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mis18aQ9CZJ6 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mis18aQ9CZJ6 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mis18aQ9CZJ6 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mis18aQ9CZJ6 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Mis18aQ9CZJ6 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mis18aQ9CZJ6 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Mis18aQ9CZJ6 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Mis18aQ9CZJ6 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mis18aQ9CZJ6 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Mis18aQ9CZJ6 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Mis18aQ9CZJ6 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Mis18aQ9CZJ6 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Mis18aQ9CZJ6 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Mis18aQ9CZJ6 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Mis18aQ9CZJ6 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Mis18aQ9CZJ6 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Mis18aQ9CZJ6 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.3 ms