Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY57

Chtop, Chromatin target of PRMT1 protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 249 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChtopQ9CY57 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
ChtopQ9CY57 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
ChtopQ9CY57 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
ChtopQ9CY57 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
ChtopQ9CY57 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
ChtopQ9CY57 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
ChtopQ9CY57 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
ChtopQ9CY57 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
ChtopQ9CY57 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
ChtopQ9CY57 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
ChtopQ9CY57 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
ChtopQ9CY57 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
ChtopQ9CY57 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
ChtopQ9CY57 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
ChtopQ9CY57 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
ChtopQ9CY57 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
ChtopQ9CY57 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
ChtopQ9CY57 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
ChtopQ9CY57 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
ChtopQ9CY57 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
ChtopQ9CY57 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
ChtopQ9CY57 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
ChtopQ9CY57 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
ChtopQ9CY57 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
ChtopQ9CY57 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
ChtopQ9CY57 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
ChtopQ9CY57 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
ChtopQ9CY57 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
ChtopQ9CY57 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
ChtopQ9CY57 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
ChtopQ9CY57 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
ChtopQ9CY57 Gm10110-202ENSMUST00000228705 3220 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
ChtopQ9CY57 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
ChtopQ9CY57 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
ChtopQ9CY57 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
ChtopQ9CY57 Mlc1-201ENSMUST00000042594 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
ChtopQ9CY57 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
ChtopQ9CY57 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
ChtopQ9CY57 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
ChtopQ9CY57 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
ChtopQ9CY57 Gm38115-201ENSMUST00000194317 2413 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
ChtopQ9CY57 Zyg11a-201ENSMUST00000043793 2289 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
ChtopQ9CY57 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
ChtopQ9CY57 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
ChtopQ9CY57 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
ChtopQ9CY57 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
ChtopQ9CY57 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
ChtopQ9CY57 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
ChtopQ9CY57 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
ChtopQ9CY57 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
ChtopQ9CY57 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
ChtopQ9CY57 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
ChtopQ9CY57 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
ChtopQ9CY57 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
ChtopQ9CY57 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
ChtopQ9CY57 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
ChtopQ9CY57 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
ChtopQ9CY57 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
ChtopQ9CY57 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
ChtopQ9CY57 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
ChtopQ9CY57 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
ChtopQ9CY57 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
ChtopQ9CY57 Plod3-201ENSMUST00000004968 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
ChtopQ9CY57 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
ChtopQ9CY57 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
ChtopQ9CY57 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
ChtopQ9CY57 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
ChtopQ9CY57 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
ChtopQ9CY57 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
ChtopQ9CY57 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
ChtopQ9CY57 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
ChtopQ9CY57 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
ChtopQ9CY57 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
ChtopQ9CY57 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
ChtopQ9CY57 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
ChtopQ9CY57 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
ChtopQ9CY57 CT025678.1-201ENSMUST00000214795 2972 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
ChtopQ9CY57 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
ChtopQ9CY57 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
ChtopQ9CY57 6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 2094 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
ChtopQ9CY57 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
ChtopQ9CY57 AC122881.1-201ENSMUST00000225757 2695 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
ChtopQ9CY57 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
ChtopQ9CY57 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
ChtopQ9CY57 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
ChtopQ9CY57 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
ChtopQ9CY57 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
ChtopQ9CY57 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
ChtopQ9CY57 Asl-203ENSMUST00000160129 2413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
ChtopQ9CY57 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
ChtopQ9CY57 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
ChtopQ9CY57 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
ChtopQ9CY57 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
ChtopQ9CY57 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
ChtopQ9CY57 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
ChtopQ9CY57 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
ChtopQ9CY57 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
ChtopQ9CY57 Wdr4-207ENSMUST00000171171 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
ChtopQ9CY57 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
ChtopQ9CY57 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
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