Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY25

Mis12, Protein MIS12 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mis12Q9CY25 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Mis12Q9CY25 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Mis12Q9CY25 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Mis12Q9CY25 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Mis12Q9CY25 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Mis12Q9CY25 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Mis12Q9CY25 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Mis12Q9CY25 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Mis12Q9CY25 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Mis12Q9CY25 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Mis12Q9CY25 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Mis12Q9CY25 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Mis12Q9CY25 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Mis12Q9CY25 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Mis12Q9CY25 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Mis12Q9CY25 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Mis12Q9CY25 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Mis12Q9CY25 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Mis12Q9CY25 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Mis12Q9CY25 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Mis12Q9CY25 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Mis12Q9CY25 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Mis12Q9CY25 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Mis12Q9CY25 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Mis12Q9CY25 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Mis12Q9CY25 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Mis12Q9CY25 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Mis12Q9CY25 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Mis12Q9CY25 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Mis12Q9CY25 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Mis12Q9CY25 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Mis12Q9CY25 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Mis12Q9CY25 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Mis12Q9CY25 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Mis12Q9CY25 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Mis12Q9CY25 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Mis12Q9CY25 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Mis12Q9CY25 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Mis12Q9CY25 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Mis12Q9CY25 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Mis12Q9CY25 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Mis12Q9CY25 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Mis12Q9CY25 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Mis12Q9CY25 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Mis12Q9CY25 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Mis12Q9CY25 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Mis12Q9CY25 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Mis12Q9CY25 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Mis12Q9CY25 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Mis12Q9CY25 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Mis12Q9CY25 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Mis12Q9CY25 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Mis12Q9CY25 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Mis12Q9CY25 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Mis12Q9CY25 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Mis12Q9CY25 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Mis12Q9CY25 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Mis12Q9CY25 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Mis12Q9CY25 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Mis12Q9CY25 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Mis12Q9CY25 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Mis12Q9CY25 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Mis12Q9CY25 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Mis12Q9CY25 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Mis12Q9CY25 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Mis12Q9CY25 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Mis12Q9CY25 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Mis12Q9CY25 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Mis12Q9CY25 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Mis12Q9CY25 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Mis12Q9CY25 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Mis12Q9CY25 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Mis12Q9CY25 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Mis12Q9CY25 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Mis12Q9CY25 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Mis12Q9CY25 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Mis12Q9CY25 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Mis12Q9CY25 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Mis12Q9CY25 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Mis12Q9CY25 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Mis12Q9CY25 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Mis12Q9CY25 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Mis12Q9CY25 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Mis12Q9CY25 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Mis12Q9CY25 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Mis12Q9CY25 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Mis12Q9CY25 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Mis12Q9CY25 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Mis12Q9CY25 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Mis12Q9CY25 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Mis12Q9CY25 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Mis12Q9CY25 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Mis12Q9CY25 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Mis12Q9CY25 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Mis12Q9CY25 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Mis12Q9CY25 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Mis12Q9CY25 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Mis12Q9CY25 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Mis12Q9CY25 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Mis12Q9CY25 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms