Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWY9

Rpain, RPA-interacting protein, mousemouse

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Length 219 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RpainQ9CWY9 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
RpainQ9CWY9 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
RpainQ9CWY9 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
RpainQ9CWY9 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
RpainQ9CWY9 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
RpainQ9CWY9 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
RpainQ9CWY9 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
RpainQ9CWY9 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
RpainQ9CWY9 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
RpainQ9CWY9 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
RpainQ9CWY9 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
RpainQ9CWY9 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
RpainQ9CWY9 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
RpainQ9CWY9 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
RpainQ9CWY9 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
RpainQ9CWY9 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
RpainQ9CWY9 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
RpainQ9CWY9 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
RpainQ9CWY9 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
RpainQ9CWY9 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
RpainQ9CWY9 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
RpainQ9CWY9 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
RpainQ9CWY9 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
RpainQ9CWY9 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
RpainQ9CWY9 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
RpainQ9CWY9 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
RpainQ9CWY9 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
RpainQ9CWY9 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
RpainQ9CWY9 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
RpainQ9CWY9 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
RpainQ9CWY9 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
RpainQ9CWY9 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
RpainQ9CWY9 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
RpainQ9CWY9 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
RpainQ9CWY9 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
RpainQ9CWY9 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
RpainQ9CWY9 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
RpainQ9CWY9 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
RpainQ9CWY9 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
RpainQ9CWY9 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
RpainQ9CWY9 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
RpainQ9CWY9 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
RpainQ9CWY9 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
RpainQ9CWY9 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
RpainQ9CWY9 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
RpainQ9CWY9 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
RpainQ9CWY9 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
RpainQ9CWY9 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
RpainQ9CWY9 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
RpainQ9CWY9 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
RpainQ9CWY9 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
RpainQ9CWY9 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
RpainQ9CWY9 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
RpainQ9CWY9 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
RpainQ9CWY9 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
RpainQ9CWY9 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
RpainQ9CWY9 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC14.18□□□□□ -0.14
RpainQ9CWY9 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
RpainQ9CWY9 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
RpainQ9CWY9 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
RpainQ9CWY9 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
RpainQ9CWY9 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
RpainQ9CWY9 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
RpainQ9CWY9 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
RpainQ9CWY9 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
RpainQ9CWY9 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
RpainQ9CWY9 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
RpainQ9CWY9 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
RpainQ9CWY9 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
RpainQ9CWY9 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
RpainQ9CWY9 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
RpainQ9CWY9 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
RpainQ9CWY9 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
RpainQ9CWY9 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
RpainQ9CWY9 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
RpainQ9CWY9 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
RpainQ9CWY9 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
RpainQ9CWY9 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
RpainQ9CWY9 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
RpainQ9CWY9 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
RpainQ9CWY9 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
RpainQ9CWY9 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
RpainQ9CWY9 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
RpainQ9CWY9 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
RpainQ9CWY9 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
RpainQ9CWY9 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
RpainQ9CWY9 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
RpainQ9CWY9 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
RpainQ9CWY9 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
RpainQ9CWY9 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
RpainQ9CWY9 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
RpainQ9CWY9 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC14.17□□□□□ -0.14
RpainQ9CWY9 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
RpainQ9CWY9 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
RpainQ9CWY9 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
RpainQ9CWY9 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
RpainQ9CWY9 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
RpainQ9CWY9 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
RpainQ9CWY9 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
RpainQ9CWY9 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
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