Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWT6

Ddx28, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 540 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx28Q9CWT6 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ddx28Q9CWT6 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ddx28Q9CWT6 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ddx28Q9CWT6 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ddx28Q9CWT6 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ddx28Q9CWT6 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ddx28Q9CWT6 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ddx28Q9CWT6 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ddx28Q9CWT6 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ddx28Q9CWT6 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ddx28Q9CWT6 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ddx28Q9CWT6 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Ddx28Q9CWT6 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ddx28Q9CWT6 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ddx28Q9CWT6 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ddx28Q9CWT6 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ddx28Q9CWT6 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ddx28Q9CWT6 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ddx28Q9CWT6 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ddx28Q9CWT6 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ddx28Q9CWT6 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ddx28Q9CWT6 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ddx28Q9CWT6 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ddx28Q9CWT6 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ddx28Q9CWT6 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ddx28Q9CWT6 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Ddx28Q9CWT6 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Ddx28Q9CWT6 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ddx28Q9CWT6 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ddx28Q9CWT6 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ddx28Q9CWT6 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ddx28Q9CWT6 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ddx28Q9CWT6 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ddx28Q9CWT6 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ddx28Q9CWT6 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ddx28Q9CWT6 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ddx28Q9CWT6 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ddx28Q9CWT6 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ddx28Q9CWT6 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ddx28Q9CWT6 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ddx28Q9CWT6 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ddx28Q9CWT6 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ddx28Q9CWT6 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ddx28Q9CWT6 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ddx28Q9CWT6 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ddx28Q9CWT6 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ddx28Q9CWT6 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ddx28Q9CWT6 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ddx28Q9CWT6 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ddx28Q9CWT6 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ddx28Q9CWT6 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ddx28Q9CWT6 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ddx28Q9CWT6 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ddx28Q9CWT6 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ddx28Q9CWT6 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ddx28Q9CWT6 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ddx28Q9CWT6 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ddx28Q9CWT6 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ddx28Q9CWT6 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ddx28Q9CWT6 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Ddx28Q9CWT6 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ddx28Q9CWT6 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ddx28Q9CWT6 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
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Ddx28Q9CWT6 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
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Ddx28Q9CWT6 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ddx28Q9CWT6 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ddx28Q9CWT6 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ddx28Q9CWT6 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ddx28Q9CWT6 Grm5-201ENSMUST00000107263 3516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ddx28Q9CWT6 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ddx28Q9CWT6 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ddx28Q9CWT6 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ddx28Q9CWT6 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ddx28Q9CWT6 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ddx28Q9CWT6 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ddx28Q9CWT6 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ddx28Q9CWT6 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ddx28Q9CWT6 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ddx28Q9CWT6 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ddx28Q9CWT6 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ddx28Q9CWT6 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ddx28Q9CWT6 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ddx28Q9CWT6 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ddx28Q9CWT6 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ddx28Q9CWT6 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ddx28Q9CWT6 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ddx28Q9CWT6 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ddx28Q9CWT6 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ddx28Q9CWT6 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ddx28Q9CWT6 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ddx28Q9CWT6 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ddx28Q9CWT6 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ddx28Q9CWT6 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ddx28Q9CWT6 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ddx28Q9CWT6 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
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