Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWD8

Nubpl, Iron-sulfur protein NUBPL, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NubplQ9CWD8 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
NubplQ9CWD8 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
NubplQ9CWD8 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
NubplQ9CWD8 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
NubplQ9CWD8 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
NubplQ9CWD8 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
NubplQ9CWD8 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
NubplQ9CWD8 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
NubplQ9CWD8 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
NubplQ9CWD8 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
NubplQ9CWD8 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
NubplQ9CWD8 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
NubplQ9CWD8 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
NubplQ9CWD8 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
NubplQ9CWD8 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
NubplQ9CWD8 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
NubplQ9CWD8 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
NubplQ9CWD8 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.43
NubplQ9CWD8 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
NubplQ9CWD8 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC12.4□□□□□ -0.43
NubplQ9CWD8 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
NubplQ9CWD8 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
NubplQ9CWD8 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
NubplQ9CWD8 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
NubplQ9CWD8 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
NubplQ9CWD8 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
NubplQ9CWD8 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
NubplQ9CWD8 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
NubplQ9CWD8 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
NubplQ9CWD8 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
NubplQ9CWD8 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
NubplQ9CWD8 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
NubplQ9CWD8 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
NubplQ9CWD8 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
NubplQ9CWD8 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
NubplQ9CWD8 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
NubplQ9CWD8 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
NubplQ9CWD8 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
NubplQ9CWD8 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
NubplQ9CWD8 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
NubplQ9CWD8 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
NubplQ9CWD8 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
NubplQ9CWD8 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
NubplQ9CWD8 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
NubplQ9CWD8 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
NubplQ9CWD8 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
NubplQ9CWD8 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
NubplQ9CWD8 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
NubplQ9CWD8 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
NubplQ9CWD8 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
NubplQ9CWD8 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
NubplQ9CWD8 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
NubplQ9CWD8 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
NubplQ9CWD8 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
NubplQ9CWD8 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
NubplQ9CWD8 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
NubplQ9CWD8 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
NubplQ9CWD8 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
NubplQ9CWD8 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
NubplQ9CWD8 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
NubplQ9CWD8 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
NubplQ9CWD8 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
NubplQ9CWD8 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
NubplQ9CWD8 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
NubplQ9CWD8 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
NubplQ9CWD8 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
NubplQ9CWD8 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
NubplQ9CWD8 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
NubplQ9CWD8 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
NubplQ9CWD8 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
NubplQ9CWD8 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
NubplQ9CWD8 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
NubplQ9CWD8 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
NubplQ9CWD8 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
NubplQ9CWD8 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
NubplQ9CWD8 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
NubplQ9CWD8 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
NubplQ9CWD8 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
NubplQ9CWD8 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
NubplQ9CWD8 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
NubplQ9CWD8 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
NubplQ9CWD8 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
NubplQ9CWD8 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
NubplQ9CWD8 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
NubplQ9CWD8 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
NubplQ9CWD8 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
NubplQ9CWD8 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
NubplQ9CWD8 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
NubplQ9CWD8 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
NubplQ9CWD8 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
NubplQ9CWD8 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
NubplQ9CWD8 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
NubplQ9CWD8 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
NubplQ9CWD8 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
NubplQ9CWD8 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
NubplQ9CWD8 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
NubplQ9CWD8 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
NubplQ9CWD8 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
NubplQ9CWD8 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
NubplQ9CWD8 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms