Protein–RNA interactions for Protein: Q9CTH6

Fcf1, rRNA-processing protein FCF1 homolog, mousemouse

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Length 198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fcf1Q9CTH6 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Fcf1Q9CTH6 Nr6a1os-201ENSMUST00000129089 645 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Fcf1Q9CTH6 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Fcf1Q9CTH6 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Fcf1Q9CTH6 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Fcf1Q9CTH6 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Fcf1Q9CTH6 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Fcf1Q9CTH6 Gm29013-201ENSMUST00000187431 237 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Fcf1Q9CTH6 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Fcf1Q9CTH6 Gm43692-201ENSMUST00000198236 1062 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Fcf1Q9CTH6 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Fcf1Q9CTH6 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Fcf1Q9CTH6 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Fcf1Q9CTH6 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Fcf1Q9CTH6 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Fcf1Q9CTH6 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Fcf1Q9CTH6 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Fcf1Q9CTH6 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Fcf1Q9CTH6 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Fcf1Q9CTH6 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Fcf1Q9CTH6 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Fcf1Q9CTH6 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Fcf1Q9CTH6 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Fcf1Q9CTH6 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Fcf1Q9CTH6 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Fcf1Q9CTH6 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Fcf1Q9CTH6 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Fcf1Q9CTH6 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Fcf1Q9CTH6 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Fcf1Q9CTH6 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Fcf1Q9CTH6 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Fcf1Q9CTH6 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Fcf1Q9CTH6 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Fcf1Q9CTH6 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Fcf1Q9CTH6 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Fcf1Q9CTH6 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Fcf1Q9CTH6 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Fcf1Q9CTH6 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Fcf1Q9CTH6 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Fcf1Q9CTH6 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Fcf1Q9CTH6 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Fcf1Q9CTH6 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Fcf1Q9CTH6 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Fcf1Q9CTH6 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Fcf1Q9CTH6 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Fcf1Q9CTH6 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Fcf1Q9CTH6 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Fcf1Q9CTH6 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Fcf1Q9CTH6 Rnase9-201ENSMUST00000064214 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Fcf1Q9CTH6 4933400A11Rik-201ENSMUST00000068874 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Fcf1Q9CTH6 4933400A11Rik-202ENSMUST00000068894 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Fcf1Q9CTH6 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Fcf1Q9CTH6 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Fcf1Q9CTH6 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Fcf1Q9CTH6 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Fcf1Q9CTH6 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Fcf1Q9CTH6 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Fcf1Q9CTH6 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Fcf1Q9CTH6 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Fcf1Q9CTH6 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Fcf1Q9CTH6 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Fcf1Q9CTH6 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Fcf1Q9CTH6 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Fcf1Q9CTH6 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Fcf1Q9CTH6 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Fcf1Q9CTH6 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Fcf1Q9CTH6 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Fcf1Q9CTH6 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Fcf1Q9CTH6 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Fcf1Q9CTH6 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Fcf1Q9CTH6 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Fcf1Q9CTH6 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Fcf1Q9CTH6 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Fcf1Q9CTH6 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Fcf1Q9CTH6 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Fcf1Q9CTH6 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Fcf1Q9CTH6 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Fcf1Q9CTH6 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Fcf1Q9CTH6 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Fcf1Q9CTH6 Gm11077-201ENSMUST00000111844 84 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Fcf1Q9CTH6 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Fcf1Q9CTH6 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Fcf1Q9CTH6 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Fcf1Q9CTH6 Vmn1r-ps144-201ENSMUST00000177291 939 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Fcf1Q9CTH6 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Fcf1Q9CTH6 Gm17917-201ENSMUST00000218561 953 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Fcf1Q9CTH6 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Fcf1Q9CTH6 Gm36377-201ENSMUST00000220833 757 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Fcf1Q9CTH6 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Fcf1Q9CTH6 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Fcf1Q9CTH6 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Fcf1Q9CTH6 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Fcf1Q9CTH6 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Fcf1Q9CTH6 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Fcf1Q9CTH6 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Fcf1Q9CTH6 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Fcf1Q9CTH6 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Fcf1Q9CTH6 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Fcf1Q9CTH6 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Fcf1Q9CTH6 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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