Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQA5

Med4, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med4Q9CQA5 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Med4Q9CQA5 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Med4Q9CQA5 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Med4Q9CQA5 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Med4Q9CQA5 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Med4Q9CQA5 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Med4Q9CQA5 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Med4Q9CQA5 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Med4Q9CQA5 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Med4Q9CQA5 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Med4Q9CQA5 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Med4Q9CQA5 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Med4Q9CQA5 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Med4Q9CQA5 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Med4Q9CQA5 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Med4Q9CQA5 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Med4Q9CQA5 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Med4Q9CQA5 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Med4Q9CQA5 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Med4Q9CQA5 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Med4Q9CQA5 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Med4Q9CQA5 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Med4Q9CQA5 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Med4Q9CQA5 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Med4Q9CQA5 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Med4Q9CQA5 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Med4Q9CQA5 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Med4Q9CQA5 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Med4Q9CQA5 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Med4Q9CQA5 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Med4Q9CQA5 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Med4Q9CQA5 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Med4Q9CQA5 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Med4Q9CQA5 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Med4Q9CQA5 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Med4Q9CQA5 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Med4Q9CQA5 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Med4Q9CQA5 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Med4Q9CQA5 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Med4Q9CQA5 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Med4Q9CQA5 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Med4Q9CQA5 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Med4Q9CQA5 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Med4Q9CQA5 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Med4Q9CQA5 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Med4Q9CQA5 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Med4Q9CQA5 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Med4Q9CQA5 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Med4Q9CQA5 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Med4Q9CQA5 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Med4Q9CQA5 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Med4Q9CQA5 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Med4Q9CQA5 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Med4Q9CQA5 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Med4Q9CQA5 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Med4Q9CQA5 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Med4Q9CQA5 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Med4Q9CQA5 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Med4Q9CQA5 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Med4Q9CQA5 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Med4Q9CQA5 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Med4Q9CQA5 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Med4Q9CQA5 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Med4Q9CQA5 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Med4Q9CQA5 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Med4Q9CQA5 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Med4Q9CQA5 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Med4Q9CQA5 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Med4Q9CQA5 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Med4Q9CQA5 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Med4Q9CQA5 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Med4Q9CQA5 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Med4Q9CQA5 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Med4Q9CQA5 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Med4Q9CQA5 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Med4Q9CQA5 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Med4Q9CQA5 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Med4Q9CQA5 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Med4Q9CQA5 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Med4Q9CQA5 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Med4Q9CQA5 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Med4Q9CQA5 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Med4Q9CQA5 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Med4Q9CQA5 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Med4Q9CQA5 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Med4Q9CQA5 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Med4Q9CQA5 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Med4Q9CQA5 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Med4Q9CQA5 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Med4Q9CQA5 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Med4Q9CQA5 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Med4Q9CQA5 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Med4Q9CQA5 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Med4Q9CQA5 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Med4Q9CQA5 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Med4Q9CQA5 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Med4Q9CQA5 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Med4Q9CQA5 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Med4Q9CQA5 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Med4Q9CQA5 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms