Protein–RNA interactions for Protein: Q99N13

Hdac9, Histone deacetylase 9, mousemouse

Predictions only

Length 588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac9Q99N13 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hdac9Q99N13 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hdac9Q99N13 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hdac9Q99N13 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hdac9Q99N13 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hdac9Q99N13 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hdac9Q99N13 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hdac9Q99N13 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hdac9Q99N13 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hdac9Q99N13 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hdac9Q99N13 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hdac9Q99N13 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Hdac9Q99N13 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hdac9Q99N13 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Hdac9Q99N13 Gm6334-201ENSMUST00000207083 228 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Hdac9Q99N13 Gm45865-201ENSMUST00000211815 945 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Hdac9Q99N13 AC159747.1-201ENSMUST00000219903 265 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Hdac9Q99N13 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hdac9Q99N13 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hdac9Q99N13 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hdac9Q99N13 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hdac9Q99N13 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hdac9Q99N13 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hdac9Q99N13 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hdac9Q99N13 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hdac9Q99N13 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hdac9Q99N13 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hdac9Q99N13 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hdac9Q99N13 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hdac9Q99N13 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hdac9Q99N13 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hdac9Q99N13 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hdac9Q99N13 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hdac9Q99N13 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hdac9Q99N13 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hdac9Q99N13 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hdac9Q99N13 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hdac9Q99N13 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Hdac9Q99N13 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hdac9Q99N13 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hdac9Q99N13 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hdac9Q99N13 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hdac9Q99N13 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Hdac9Q99N13 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hdac9Q99N13 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hdac9Q99N13 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hdac9Q99N13 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hdac9Q99N13 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hdac9Q99N13 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hdac9Q99N13 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hdac9Q99N13 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hdac9Q99N13 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hdac9Q99N13 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hdac9Q99N13 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hdac9Q99N13 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hdac9Q99N13 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hdac9Q99N13 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hdac9Q99N13 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hdac9Q99N13 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hdac9Q99N13 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hdac9Q99N13 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hdac9Q99N13 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hdac9Q99N13 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hdac9Q99N13 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Hdac9Q99N13 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hdac9Q99N13 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Hdac9Q99N13 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hdac9Q99N13 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hdac9Q99N13 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hdac9Q99N13 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hdac9Q99N13 Mir877-201ENSMUST00000104738 85 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Hdac9Q99N13 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hdac9Q99N13 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Hdac9Q99N13 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Hdac9Q99N13 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hdac9Q99N13 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hdac9Q99N13 Gm18827-201ENSMUST00000188341 790 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Hdac9Q99N13 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hdac9Q99N13 Gm35409-201ENSMUST00000196412 1102 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hdac9Q99N13 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hdac9Q99N13 Fxyd1-217ENSMUST00000206860 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hdac9Q99N13 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hdac9Q99N13 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hdac9Q99N13 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hdac9Q99N13 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Hdac9Q99N13 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hdac9Q99N13 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hdac9Q99N13 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hdac9Q99N13 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hdac9Q99N13 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hdac9Q99N13 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hdac9Q99N13 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Hdac9Q99N13 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hdac9Q99N13 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hdac9Q99N13 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hdac9Q99N13 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hdac9Q99N13 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hdac9Q99N13 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hdac9Q99N13 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hdac9Q99N13 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.9 ms