Protein–RNA interactions for Protein: Q99M80

Ptprt, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, mousemouse

Predictions only

Length 1,454 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprtQ99M80 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PtprtQ99M80 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PtprtQ99M80 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PtprtQ99M80 Gm13812-201ENSMUST00000118061 1347 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
PtprtQ99M80 Gm13810-201ENSMUST00000118584 1347 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
PtprtQ99M80 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PtprtQ99M80 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PtprtQ99M80 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PtprtQ99M80 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PtprtQ99M80 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PtprtQ99M80 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PtprtQ99M80 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PtprtQ99M80 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PtprtQ99M80 Rpl41-206ENSMUST00000177163 544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PtprtQ99M80 3110045C21Rik-201ENSMUST00000180638 1135 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PtprtQ99M80 Nat8f6-201ENSMUST00000087656 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PtprtQ99M80 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PtprtQ99M80 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PtprtQ99M80 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PtprtQ99M80 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PtprtQ99M80 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PtprtQ99M80 Slc6a9-210ENSMUST00000169885 1876 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PtprtQ99M80 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
PtprtQ99M80 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PtprtQ99M80 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PtprtQ99M80 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PtprtQ99M80 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PtprtQ99M80 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PtprtQ99M80 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PtprtQ99M80 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PtprtQ99M80 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PtprtQ99M80 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PtprtQ99M80 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PtprtQ99M80 Hax1-205ENSMUST00000197767 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PtprtQ99M80 Gm29797-201ENSMUST00000207856 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PtprtQ99M80 Actg-ps1-201ENSMUST00000099636 1124 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
PtprtQ99M80 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PtprtQ99M80 Wdr31-201ENSMUST00000030087 1440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PtprtQ99M80 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
PtprtQ99M80 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PtprtQ99M80 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
PtprtQ99M80 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PtprtQ99M80 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PtprtQ99M80 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PtprtQ99M80 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PtprtQ99M80 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PtprtQ99M80 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PtprtQ99M80 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PtprtQ99M80 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PtprtQ99M80 Gm11980-201ENSMUST00000121445 986 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
PtprtQ99M80 Ankrd29-202ENSMUST00000122408 850 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PtprtQ99M80 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PtprtQ99M80 Gm28778-201ENSMUST00000190734 785 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PtprtQ99M80 Gm43692-201ENSMUST00000198236 1062 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
PtprtQ99M80 4933408A14Rik-201ENSMUST00000199037 729 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PtprtQ99M80 Gsto1-201ENSMUST00000026050 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PtprtQ99M80 Smco2-201ENSMUST00000032433 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PtprtQ99M80 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PtprtQ99M80 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PtprtQ99M80 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PtprtQ99M80 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PtprtQ99M80 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PtprtQ99M80 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PtprtQ99M80 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PtprtQ99M80 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PtprtQ99M80 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PtprtQ99M80 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PtprtQ99M80 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
PtprtQ99M80 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PtprtQ99M80 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
PtprtQ99M80 Pstpip2-201ENSMUST00000114741 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PtprtQ99M80 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PtprtQ99M80 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PtprtQ99M80 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PtprtQ99M80 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PtprtQ99M80 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PtprtQ99M80 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
PtprtQ99M80 AA545190-201ENSMUST00000203495 1053 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PtprtQ99M80 Mt1-202ENSMUST00000211807 1085 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
PtprtQ99M80 Fam151b-201ENSMUST00000040106 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PtprtQ99M80 Zfp809-201ENSMUST00000072465 1425 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PtprtQ99M80 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PtprtQ99M80 Gm42941-201ENSMUST00000200347 1321 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
PtprtQ99M80 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PtprtQ99M80 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PtprtQ99M80 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PtprtQ99M80 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PtprtQ99M80 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PtprtQ99M80 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PtprtQ99M80 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PtprtQ99M80 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PtprtQ99M80 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
PtprtQ99M80 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PtprtQ99M80 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PtprtQ99M80 Mup-ps26-201ENSMUST00000121751 202 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
PtprtQ99M80 BC016548-202ENSMUST00000153797 805 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PtprtQ99M80 Agtpbp1-219ENSMUST00000170378 653 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PtprtQ99M80 Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PtprtQ99M80 Gm31479-201ENSMUST00000209936 522 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PtprtQ99M80 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms