Protein–RNA interactions for Protein: Q99J79

Ddb2, DNA damage-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Ddb2Q99J79 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ddb2Q99J79 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ddb2Q99J79 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ddb2Q99J79 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Ddb2Q99J79 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
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Ddb2Q99J79 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Ddb2Q99J79 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
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Ddb2Q99J79 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
Ddb2Q99J79 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Ddb2Q99J79 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
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Ddb2Q99J79 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ddb2Q99J79 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
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Ddb2Q99J79 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ddb2Q99J79 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Ddb2Q99J79 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
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Ddb2Q99J79 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
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Ddb2Q99J79 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ddb2Q99J79 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ddb2Q99J79 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ddb2Q99J79 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ddb2Q99J79 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ddb2Q99J79 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ddb2Q99J79 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ddb2Q99J79 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ddb2Q99J79 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ddb2Q99J79 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Ddb2Q99J79 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
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Ddb2Q99J79 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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