Protein–RNA interactions for Protein: Q925N4

Cldn16, Claudin-16, mousemouse

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Length 235 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn16Q925N4 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Cldn16Q925N4 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cldn16Q925N4 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cldn16Q925N4 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cldn16Q925N4 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cldn16Q925N4 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cldn16Q925N4 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cldn16Q925N4 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cldn16Q925N4 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cldn16Q925N4 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cldn16Q925N4 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cldn16Q925N4 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cldn16Q925N4 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cldn16Q925N4 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cldn16Q925N4 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cldn16Q925N4 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cldn16Q925N4 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cldn16Q925N4 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cldn16Q925N4 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cldn16Q925N4 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cldn16Q925N4 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cldn16Q925N4 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cldn16Q925N4 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Cldn16Q925N4 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Cldn16Q925N4 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Cldn16Q925N4 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cldn16Q925N4 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cldn16Q925N4 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cldn16Q925N4 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cldn16Q925N4 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cldn16Q925N4 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cldn16Q925N4 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cldn16Q925N4 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cldn16Q925N4 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cldn16Q925N4 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cldn16Q925N4 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cldn16Q925N4 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Cldn16Q925N4 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cldn16Q925N4 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cldn16Q925N4 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cldn16Q925N4 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cldn16Q925N4 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cldn16Q925N4 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cldn16Q925N4 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cldn16Q925N4 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cldn16Q925N4 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cldn16Q925N4 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cldn16Q925N4 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cldn16Q925N4 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cldn16Q925N4 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cldn16Q925N4 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cldn16Q925N4 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cldn16Q925N4 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cldn16Q925N4 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cldn16Q925N4 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cldn16Q925N4 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cldn16Q925N4 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Cldn16Q925N4 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cldn16Q925N4 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cldn16Q925N4 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Cldn16Q925N4 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cldn16Q925N4 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cldn16Q925N4 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cldn16Q925N4 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cldn16Q925N4 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cldn16Q925N4 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cldn16Q925N4 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Cldn16Q925N4 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Cldn16Q925N4 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Cldn16Q925N4 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cldn16Q925N4 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cldn16Q925N4 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Cldn16Q925N4 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cldn16Q925N4 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cldn16Q925N4 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Cldn16Q925N4 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cldn16Q925N4 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cldn16Q925N4 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cldn16Q925N4 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cldn16Q925N4 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cldn16Q925N4 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cldn16Q925N4 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cldn16Q925N4 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cldn16Q925N4 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cldn16Q925N4 Htr2c-207ENSMUST00000156697 4654 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cldn16Q925N4 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cldn16Q925N4 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cldn16Q925N4 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cldn16Q925N4 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cldn16Q925N4 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cldn16Q925N4 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cldn16Q925N4 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cldn16Q925N4 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cldn16Q925N4 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cldn16Q925N4 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn16Q925N4 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn16Q925N4 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn16Q925N4 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn16Q925N4 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn16Q925N4 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
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