Protein–RNA interactions for Protein: Q923P0

Col20a1, Collagen alpha-1(XX) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,320 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col20a1Q923P0 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Col20a1Q923P0 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Col20a1Q923P0 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Col20a1Q923P0 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Col20a1Q923P0 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Col20a1Q923P0 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Col20a1Q923P0 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Col20a1Q923P0 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Col20a1Q923P0 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Col20a1Q923P0 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Col20a1Q923P0 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Col20a1Q923P0 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Col20a1Q923P0 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Col20a1Q923P0 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Col20a1Q923P0 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Col20a1Q923P0 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Col20a1Q923P0 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Col20a1Q923P0 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Col20a1Q923P0 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Col20a1Q923P0 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Col20a1Q923P0 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Col20a1Q923P0 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Col20a1Q923P0 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Col20a1Q923P0 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Col20a1Q923P0 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Col20a1Q923P0 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Col20a1Q923P0 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Col20a1Q923P0 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Col20a1Q923P0 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Col20a1Q923P0 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Col20a1Q923P0 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Col20a1Q923P0 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Col20a1Q923P0 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Col20a1Q923P0 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Col20a1Q923P0 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Col20a1Q923P0 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Col20a1Q923P0 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Col20a1Q923P0 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Col20a1Q923P0 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Col20a1Q923P0 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Col20a1Q923P0 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Col20a1Q923P0 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Col20a1Q923P0 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Col20a1Q923P0 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Col20a1Q923P0 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Col20a1Q923P0 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Col20a1Q923P0 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Col20a1Q923P0 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Col20a1Q923P0 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Col20a1Q923P0 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Col20a1Q923P0 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Col20a1Q923P0 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Col20a1Q923P0 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Col20a1Q923P0 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Col20a1Q923P0 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Col20a1Q923P0 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Col20a1Q923P0 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Col20a1Q923P0 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Col20a1Q923P0 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Col20a1Q923P0 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Col20a1Q923P0 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Col20a1Q923P0 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Col20a1Q923P0 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Col20a1Q923P0 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Col20a1Q923P0 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Col20a1Q923P0 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Col20a1Q923P0 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Col20a1Q923P0 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Col20a1Q923P0 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Col20a1Q923P0 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Col20a1Q923P0 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Col20a1Q923P0 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Col20a1Q923P0 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Col20a1Q923P0 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Col20a1Q923P0 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Col20a1Q923P0 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Col20a1Q923P0 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Col20a1Q923P0 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Col20a1Q923P0 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Col20a1Q923P0 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Col20a1Q923P0 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Col20a1Q923P0 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Col20a1Q923P0 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Col20a1Q923P0 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Col20a1Q923P0 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Col20a1Q923P0 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Col20a1Q923P0 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Col20a1Q923P0 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Col20a1Q923P0 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Col20a1Q923P0 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Col20a1Q923P0 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
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