Protein–RNA interactions for Protein: Q923L3

Csmd1, CUB and sushi domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 3,564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csmd1Q923L3 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Csmd1Q923L3 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Csmd1Q923L3 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Csmd1Q923L3 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Csmd1Q923L3 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Csmd1Q923L3 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Csmd1Q923L3 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Csmd1Q923L3 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Csmd1Q923L3 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Csmd1Q923L3 Gm5778-201ENSMUST00000171003 1072 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Csmd1Q923L3 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Csmd1Q923L3 Gm39185-201ENSMUST00000212941 540 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Csmd1Q923L3 Timm9-201ENSMUST00000021486 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Csmd1Q923L3 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Csmd1Q923L3 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Csmd1Q923L3 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Csmd1Q923L3 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Csmd1Q923L3 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Csmd1Q923L3 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Csmd1Q923L3 Nr1i3-202ENSMUST00000075469 1305 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Csmd1Q923L3 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Csmd1Q923L3 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Csmd1Q923L3 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Csmd1Q923L3 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Csmd1Q923L3 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC11.15□□□□□ -0.63
Csmd1Q923L3 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Csmd1Q923L3 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Csmd1Q923L3 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Csmd1Q923L3 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Csmd1Q923L3 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Csmd1Q923L3 Lce1e-201ENSMUST00000090867 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Csmd1Q923L3 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Csmd1Q923L3 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Csmd1Q923L3 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Csmd1Q923L3 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Csmd1Q923L3 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Csmd1Q923L3 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Csmd1Q923L3 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Csmd1Q923L3 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Csmd1Q923L3 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Csmd1Q923L3 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Csmd1Q923L3 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Csmd1Q923L3 Gm44136-201ENSMUST00000203819 1106 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Csmd1Q923L3 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Csmd1Q923L3 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Csmd1Q923L3 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Csmd1Q923L3 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Csmd1Q923L3 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Csmd1Q923L3 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Csmd1Q923L3 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Csmd1Q923L3 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Csmd1Q923L3 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Csmd1Q923L3 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Csmd1Q923L3 Gm12690-201ENSMUST00000132108 354 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Csmd1Q923L3 Gm7666-201ENSMUST00000146631 819 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Csmd1Q923L3 Gm19353-201ENSMUST00000184561 445 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Csmd1Q923L3 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Csmd1Q923L3 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Csmd1Q923L3 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Csmd1Q923L3 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Csmd1Q923L3 Cox6a2-201ENSMUST00000033049 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Csmd1Q923L3 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Csmd1Q923L3 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Csmd1Q923L3 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Csmd1Q923L3 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Csmd1Q923L3 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Csmd1Q923L3 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Csmd1Q923L3 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Csmd1Q923L3 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Csmd1Q923L3 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Csmd1Q923L3 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Csmd1Q923L3 Hcfc1r1-203ENSMUST00000180140 693 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Csmd1Q923L3 Gm7003-201ENSMUST00000195089 312 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Csmd1Q923L3 Gm9555-201ENSMUST00000200908 583 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Csmd1Q923L3 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Csmd1Q923L3 AC134869.3-201ENSMUST00000225581 343 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Csmd1Q923L3 AC135469.1-201ENSMUST00000225984 772 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Csmd1Q923L3 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Csmd1Q923L3 Ccdc153-201ENSMUST00000092426 1087 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Csmd1Q923L3 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Csmd1Q923L3 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Csmd1Q923L3 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Csmd1Q923L3 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Csmd1Q923L3 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Csmd1Q923L3 Bbs5-202ENSMUST00000112286 1397 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Csmd1Q923L3 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Csmd1Q923L3 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Csmd1Q923L3 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Csmd1Q923L3 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Csmd1Q923L3 Mocs2-205ENSMUST00000165022 962 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Csmd1Q923L3 Gm6771-201ENSMUST00000182716 1001 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Csmd1Q923L3 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Csmd1Q923L3 Gm32141-201ENSMUST00000220189 488 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Csmd1Q923L3 AC132901.1-201ENSMUST00000224345 508 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Csmd1Q923L3 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Csmd1Q923L3 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Csmd1Q923L3 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Csmd1Q923L3 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Csmd1Q923L3 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Csmd1Q923L3 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.8 ms