Protein–RNA interactions for Protein: Q922F4

Tubb6, Tubulin beta-6 chain, mousemouse

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb6Q922F4 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tubb6Q922F4 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tubb6Q922F4 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tubb6Q922F4 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tubb6Q922F4 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tubb6Q922F4 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Tubb6Q922F4 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tubb6Q922F4 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tubb6Q922F4 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tubb6Q922F4 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tubb6Q922F4 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tubb6Q922F4 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tubb6Q922F4 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tubb6Q922F4 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tubb6Q922F4 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tubb6Q922F4 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tubb6Q922F4 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tubb6Q922F4 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tubb6Q922F4 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tubb6Q922F4 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tubb6Q922F4 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tubb6Q922F4 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tubb6Q922F4 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tubb6Q922F4 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tubb6Q922F4 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tubb6Q922F4 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tubb6Q922F4 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tubb6Q922F4 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tubb6Q922F4 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tubb6Q922F4 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tubb6Q922F4 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tubb6Q922F4 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tubb6Q922F4 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tubb6Q922F4 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tubb6Q922F4 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tubb6Q922F4 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tubb6Q922F4 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Tubb6Q922F4 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tubb6Q922F4 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tubb6Q922F4 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Tubb6Q922F4 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Tubb6Q922F4 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Tubb6Q922F4 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tubb6Q922F4 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tubb6Q922F4 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tubb6Q922F4 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tubb6Q922F4 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tubb6Q922F4 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tubb6Q922F4 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tubb6Q922F4 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tubb6Q922F4 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tubb6Q922F4 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tubb6Q922F4 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tubb6Q922F4 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tubb6Q922F4 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tubb6Q922F4 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tubb6Q922F4 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tubb6Q922F4 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tubb6Q922F4 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tubb6Q922F4 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tubb6Q922F4 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tubb6Q922F4 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tubb6Q922F4 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tubb6Q922F4 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tubb6Q922F4 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tubb6Q922F4 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tubb6Q922F4 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tubb6Q922F4 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tubb6Q922F4 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tubb6Q922F4 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Tubb6Q922F4 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tubb6Q922F4 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tubb6Q922F4 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tubb6Q922F4 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tubb6Q922F4 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tubb6Q922F4 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tubb6Q922F4 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tubb6Q922F4 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tubb6Q922F4 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tubb6Q922F4 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tubb6Q922F4 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tubb6Q922F4 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tubb6Q922F4 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tubb6Q922F4 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tubb6Q922F4 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tubb6Q922F4 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tubb6Q922F4 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tubb6Q922F4 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tubb6Q922F4 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tubb6Q922F4 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tubb6Q922F4 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tubb6Q922F4 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tubb6Q922F4 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tubb6Q922F4 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Tubb6Q922F4 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tubb6Q922F4 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Tubb6Q922F4 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tubb6Q922F4 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tubb6Q922F4 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tubb6Q922F4 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.3 ms