Protein–RNA interactions for Protein: Q91YH5

Atl3, Atlastin-3, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atl3Q91YH5 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atl3Q91YH5 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atl3Q91YH5 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atl3Q91YH5 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atl3Q91YH5 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atl3Q91YH5 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atl3Q91YH5 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atl3Q91YH5 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atl3Q91YH5 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atl3Q91YH5 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atl3Q91YH5 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atl3Q91YH5 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atl3Q91YH5 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atl3Q91YH5 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Atl3Q91YH5 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Atl3Q91YH5 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Atl3Q91YH5 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atl3Q91YH5 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Atl3Q91YH5 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atl3Q91YH5 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atl3Q91YH5 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atl3Q91YH5 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atl3Q91YH5 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atl3Q91YH5 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atl3Q91YH5 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atl3Q91YH5 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atl3Q91YH5 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atl3Q91YH5 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atl3Q91YH5 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atl3Q91YH5 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atl3Q91YH5 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Atl3Q91YH5 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Atl3Q91YH5 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Atl3Q91YH5 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Atl3Q91YH5 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Atl3Q91YH5 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Atl3Q91YH5 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Atl3Q91YH5 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Atl3Q91YH5 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Atl3Q91YH5 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Atl3Q91YH5 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Atl3Q91YH5 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Atl3Q91YH5 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Atl3Q91YH5 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Atl3Q91YH5 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Atl3Q91YH5 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Atl3Q91YH5 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Atl3Q91YH5 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Atl3Q91YH5 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Atl3Q91YH5 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Atl3Q91YH5 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Atl3Q91YH5 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Atl3Q91YH5 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Atl3Q91YH5 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Atl3Q91YH5 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atl3Q91YH5 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atl3Q91YH5 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atl3Q91YH5 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atl3Q91YH5 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atl3Q91YH5 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Atl3Q91YH5 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atl3Q91YH5 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atl3Q91YH5 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atl3Q91YH5 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atl3Q91YH5 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atl3Q91YH5 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atl3Q91YH5 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atl3Q91YH5 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atl3Q91YH5 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atl3Q91YH5 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atl3Q91YH5 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atl3Q91YH5 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atl3Q91YH5 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atl3Q91YH5 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Atl3Q91YH5 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atl3Q91YH5 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atl3Q91YH5 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atl3Q91YH5 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atl3Q91YH5 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atl3Q91YH5 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atl3Q91YH5 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Atl3Q91YH5 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atl3Q91YH5 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atl3Q91YH5 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atl3Q91YH5 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Atl3Q91YH5 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atl3Q91YH5 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atl3Q91YH5 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atl3Q91YH5 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atl3Q91YH5 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atl3Q91YH5 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atl3Q91YH5 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atl3Q91YH5 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atl3Q91YH5 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atl3Q91YH5 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Atl3Q91YH5 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atl3Q91YH5 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atl3Q91YH5 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Atl3Q91YH5 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atl3Q91YH5 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.9 ms