Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHJ7

Ppargc1b, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator 1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,014 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm45177-201ENSMUST00000209104 2307 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Ppargc1bQ8VHJ7 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ppargc1bQ8VHJ7 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ppargc1bQ8VHJ7 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ppargc1bQ8VHJ7 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ppargc1bQ8VHJ7 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ppargc1bQ8VHJ7 Aknaos-201ENSMUST00000144095 1104 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm16434-202ENSMUST00000177712 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm6676-202ENSMUST00000178376 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm37452-201ENSMUST00000194416 1160 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Ppargc1bQ8VHJ7 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ppargc1bQ8VHJ7 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ppargc1bQ8VHJ7 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ppargc1bQ8VHJ7 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ppargc1bQ8VHJ7 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ppargc1bQ8VHJ7 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ppargc1bQ8VHJ7 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ppargc1bQ8VHJ7 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ppargc1bQ8VHJ7 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ppargc1bQ8VHJ7 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ppargc1bQ8VHJ7 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ppargc1bQ8VHJ7 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ppargc1bQ8VHJ7 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ppargc1bQ8VHJ7 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Ppargc1bQ8VHJ7 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
Ppargc1bQ8VHJ7 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ppargc1bQ8VHJ7 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ppargc1bQ8VHJ7 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ppargc1bQ8VHJ7 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm37960-201ENSMUST00000192402 1897 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Ppargc1bQ8VHJ7 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ppargc1bQ8VHJ7 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ppargc1bQ8VHJ7 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ppargc1bQ8VHJ7 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Ppargc1bQ8VHJ7 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ppargc1bQ8VHJ7 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ppargc1bQ8VHJ7 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ppargc1bQ8VHJ7 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Ppargc1bQ8VHJ7 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ppargc1bQ8VHJ7 2810403D21Rik-208ENSMUST00000153212 1005 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ppargc1bQ8VHJ7 Scnm1-201ENSMUST00000172572 1054 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ppargc1bQ8VHJ7 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Ppargc1bQ8VHJ7 Vmn1r-ps19-201ENSMUST00000177008 926 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm43177-201ENSMUST00000197032 1107 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ppargc1bQ8VHJ7 4930599N24Rik-201ENSMUST00000198822 1003 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm34701-202ENSMUST00000204685 360 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Ppargc1bQ8VHJ7 Olfr1124-201ENSMUST00000062494 957 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ppargc1bQ8VHJ7 Olfr771-201ENSMUST00000078914 954 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ppargc1bQ8VHJ7 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ppargc1bQ8VHJ7 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ppargc1bQ8VHJ7 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ppargc1bQ8VHJ7 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ppargc1bQ8VHJ7 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm11685-201ENSMUST00000141559 1332 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ppargc1bQ8VHJ7 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Ppargc1bQ8VHJ7 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ppargc1bQ8VHJ7 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ppargc1bQ8VHJ7 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ppargc1bQ8VHJ7 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ppargc1bQ8VHJ7 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Ppargc1bQ8VHJ7 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm23776-201ENSMUST00000158993 325 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Ppargc1bQ8VHJ7 Olfr772-201ENSMUST00000169800 1004 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm20641-201ENSMUST00000176069 615 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ppargc1bQ8VHJ7 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm28011-201ENSMUST00000184097 175 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Ppargc1bQ8VHJ7 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ppargc1bQ8VHJ7 Olfr1468-ps1-201ENSMUST00000207287 1208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ppargc1bQ8VHJ7 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm45733-201ENSMUST00000212988 437 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Ppargc1bQ8VHJ7 AC134439.1-201ENSMUST00000220923 600 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Ppargc1bQ8VHJ7 Clec4a2-201ENSMUST00000032248 1261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ppargc1bQ8VHJ7 Olfr488-201ENSMUST00000072968 945 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ppargc1bQ8VHJ7 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ppargc1bQ8VHJ7 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ppargc1bQ8VHJ7 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ppargc1bQ8VHJ7 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ppargc1bQ8VHJ7 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ppargc1bQ8VHJ7 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ppargc1bQ8VHJ7 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ppargc1bQ8VHJ7 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ppargc1bQ8VHJ7 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ppargc1bQ8VHJ7 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ppargc1bQ8VHJ7 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ppargc1bQ8VHJ7 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ppargc1bQ8VHJ7 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ppargc1bQ8VHJ7 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ppargc1bQ8VHJ7 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ppargc1bQ8VHJ7 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms