Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCD7

Kdm4c, Lysine-specific demethylase 4C, mousemouse

Predictions only

Length 1,054 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm4cQ8VCD7 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Kdm4cQ8VCD7 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Kdm4cQ8VCD7 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Kdm4cQ8VCD7 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Kdm4cQ8VCD7 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Kdm4cQ8VCD7 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Kdm4cQ8VCD7 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Kdm4cQ8VCD7 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Kdm4cQ8VCD7 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Kdm4cQ8VCD7 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Kdm4cQ8VCD7 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Kdm4cQ8VCD7 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Kdm4cQ8VCD7 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Kdm4cQ8VCD7 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Kdm4cQ8VCD7 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Kdm4cQ8VCD7 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Kdm4cQ8VCD7 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Kdm4cQ8VCD7 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Kdm4cQ8VCD7 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Kdm4cQ8VCD7 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Kdm4cQ8VCD7 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Kdm4cQ8VCD7 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Kdm4cQ8VCD7 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Kdm4cQ8VCD7 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Kdm4cQ8VCD7 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Kdm4cQ8VCD7 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Kdm4cQ8VCD7 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Kdm4cQ8VCD7 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Kdm4cQ8VCD7 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Kdm4cQ8VCD7 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Kdm4cQ8VCD7 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Kdm4cQ8VCD7 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Kdm4cQ8VCD7 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Kdm4cQ8VCD7 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Kdm4cQ8VCD7 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Kdm4cQ8VCD7 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Kdm4cQ8VCD7 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Kdm4cQ8VCD7 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Kdm4cQ8VCD7 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Kdm4cQ8VCD7 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Kdm4cQ8VCD7 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Kdm4cQ8VCD7 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Kdm4cQ8VCD7 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Kdm4cQ8VCD7 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Kdm4cQ8VCD7 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Kdm4cQ8VCD7 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Kdm4cQ8VCD7 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Kdm4cQ8VCD7 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Kdm4cQ8VCD7 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Kdm4cQ8VCD7 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Kdm4cQ8VCD7 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Kdm4cQ8VCD7 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Kdm4cQ8VCD7 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Kdm4cQ8VCD7 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Kdm4cQ8VCD7 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Kdm4cQ8VCD7 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Kdm4cQ8VCD7 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Kdm4cQ8VCD7 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Kdm4cQ8VCD7 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Kdm4cQ8VCD7 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Kdm4cQ8VCD7 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Kdm4cQ8VCD7 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Kdm4cQ8VCD7 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Kdm4cQ8VCD7 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Kdm4cQ8VCD7 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Kdm4cQ8VCD7 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Kdm4cQ8VCD7 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Kdm4cQ8VCD7 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Kdm4cQ8VCD7 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Kdm4cQ8VCD7 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Kdm4cQ8VCD7 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Kdm4cQ8VCD7 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Kdm4cQ8VCD7 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Kdm4cQ8VCD7 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Kdm4cQ8VCD7 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Kdm4cQ8VCD7 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Kdm4cQ8VCD7 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Kdm4cQ8VCD7 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Kdm4cQ8VCD7 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Kdm4cQ8VCD7 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Kdm4cQ8VCD7 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Kdm4cQ8VCD7 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Kdm4cQ8VCD7 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Kdm4cQ8VCD7 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Kdm4cQ8VCD7 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Kdm4cQ8VCD7 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Kdm4cQ8VCD7 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Kdm4cQ8VCD7 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Kdm4cQ8VCD7 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Kdm4cQ8VCD7 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Kdm4cQ8VCD7 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Kdm4cQ8VCD7 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Kdm4cQ8VCD7 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Kdm4cQ8VCD7 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Kdm4cQ8VCD7 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Kdm4cQ8VCD7 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Kdm4cQ8VCD7 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Kdm4cQ8VCD7 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Kdm4cQ8VCD7 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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