Protein–RNA interactions for Protein: Q8VBT6

Apobr, Apolipoprotein B receptor, mousemouse

Predictions only

Length 942 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApobrQ8VBT6 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ApobrQ8VBT6 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ApobrQ8VBT6 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ApobrQ8VBT6 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ApobrQ8VBT6 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ApobrQ8VBT6 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ApobrQ8VBT6 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ApobrQ8VBT6 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ApobrQ8VBT6 Gm25668-201ENSMUST00000157700 129 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
ApobrQ8VBT6 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ApobrQ8VBT6 Mir3547-201ENSMUST00000175461 88 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
ApobrQ8VBT6 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ApobrQ8VBT6 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ApobrQ8VBT6 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ApobrQ8VBT6 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
ApobrQ8VBT6 4933424G06Rik-204ENSMUST00000208994 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ApobrQ8VBT6 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
ApobrQ8VBT6 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ApobrQ8VBT6 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ApobrQ8VBT6 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ApobrQ8VBT6 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ApobrQ8VBT6 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ApobrQ8VBT6 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ApobrQ8VBT6 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ApobrQ8VBT6 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ApobrQ8VBT6 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ApobrQ8VBT6 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ApobrQ8VBT6 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ApobrQ8VBT6 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ApobrQ8VBT6 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ApobrQ8VBT6 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ApobrQ8VBT6 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ApobrQ8VBT6 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ApobrQ8VBT6 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ApobrQ8VBT6 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ApobrQ8VBT6 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ApobrQ8VBT6 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ApobrQ8VBT6 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ApobrQ8VBT6 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ApobrQ8VBT6 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ApobrQ8VBT6 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ApobrQ8VBT6 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ApobrQ8VBT6 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ApobrQ8VBT6 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ApobrQ8VBT6 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ApobrQ8VBT6 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ApobrQ8VBT6 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ApobrQ8VBT6 Fam110a-202ENSMUST00000109863 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ApobrQ8VBT6 Gm12997-201ENSMUST00000120207 640 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
ApobrQ8VBT6 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ApobrQ8VBT6 Gm11210-201ENSMUST00000150203 422 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ApobrQ8VBT6 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ApobrQ8VBT6 AC167229.2-201ENSMUST00000218902 675 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ApobrQ8VBT6 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
ApobrQ8VBT6 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ApobrQ8VBT6 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ApobrQ8VBT6 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ApobrQ8VBT6 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ApobrQ8VBT6 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ApobrQ8VBT6 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ApobrQ8VBT6 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
ApobrQ8VBT6 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ApobrQ8VBT6 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ApobrQ8VBT6 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ApobrQ8VBT6 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ApobrQ8VBT6 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ApobrQ8VBT6 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ApobrQ8VBT6 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ApobrQ8VBT6 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ApobrQ8VBT6 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ApobrQ8VBT6 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ApobrQ8VBT6 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ApobrQ8VBT6 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ApobrQ8VBT6 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ApobrQ8VBT6 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ApobrQ8VBT6 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ApobrQ8VBT6 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ApobrQ8VBT6 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ApobrQ8VBT6 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ApobrQ8VBT6 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ApobrQ8VBT6 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ApobrQ8VBT6 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ApobrQ8VBT6 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ApobrQ8VBT6 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ApobrQ8VBT6 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ApobrQ8VBT6 Gm4819-201ENSMUST00000182170 1009 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
ApobrQ8VBT6 Gm43068-201ENSMUST00000201095 1273 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
ApobrQ8VBT6 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
ApobrQ8VBT6 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ApobrQ8VBT6 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ApobrQ8VBT6 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ApobrQ8VBT6 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ApobrQ8VBT6 Gm20646-201ENSMUST00000176807 1316 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ApobrQ8VBT6 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ApobrQ8VBT6 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ApobrQ8VBT6 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ApobrQ8VBT6 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ApobrQ8VBT6 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ApobrQ8VBT6 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ApobrQ8VBT6 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 252.9 ms