Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2Y9

Ccm2, Cerebral cavernous malformations protein 2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 453 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccm2Q8K2Y9 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccm2Q8K2Y9 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccm2Q8K2Y9 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccm2Q8K2Y9 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccm2Q8K2Y9 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccm2Q8K2Y9 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccm2Q8K2Y9 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccm2Q8K2Y9 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccm2Q8K2Y9 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccm2Q8K2Y9 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccm2Q8K2Y9 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccm2Q8K2Y9 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccm2Q8K2Y9 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccm2Q8K2Y9 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccm2Q8K2Y9 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccm2Q8K2Y9 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccm2Q8K2Y9 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccm2Q8K2Y9 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccm2Q8K2Y9 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccm2Q8K2Y9 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccm2Q8K2Y9 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccm2Q8K2Y9 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccm2Q8K2Y9 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccm2Q8K2Y9 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccm2Q8K2Y9 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccm2Q8K2Y9 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccm2Q8K2Y9 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccm2Q8K2Y9 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccm2Q8K2Y9 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccm2Q8K2Y9 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccm2Q8K2Y9 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccm2Q8K2Y9 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccm2Q8K2Y9 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccm2Q8K2Y9 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccm2Q8K2Y9 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccm2Q8K2Y9 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccm2Q8K2Y9 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccm2Q8K2Y9 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccm2Q8K2Y9 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccm2Q8K2Y9 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccm2Q8K2Y9 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccm2Q8K2Y9 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccm2Q8K2Y9 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccm2Q8K2Y9 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccm2Q8K2Y9 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccm2Q8K2Y9 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccm2Q8K2Y9 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccm2Q8K2Y9 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccm2Q8K2Y9 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccm2Q8K2Y9 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccm2Q8K2Y9 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccm2Q8K2Y9 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccm2Q8K2Y9 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccm2Q8K2Y9 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccm2Q8K2Y9 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccm2Q8K2Y9 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccm2Q8K2Y9 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccm2Q8K2Y9 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccm2Q8K2Y9 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccm2Q8K2Y9 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccm2Q8K2Y9 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccm2Q8K2Y9 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccm2Q8K2Y9 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccm2Q8K2Y9 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccm2Q8K2Y9 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccm2Q8K2Y9 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccm2Q8K2Y9 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccm2Q8K2Y9 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccm2Q8K2Y9 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccm2Q8K2Y9 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccm2Q8K2Y9 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccm2Q8K2Y9 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccm2Q8K2Y9 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccm2Q8K2Y9 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccm2Q8K2Y9 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccm2Q8K2Y9 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccm2Q8K2Y9 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccm2Q8K2Y9 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccm2Q8K2Y9 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccm2Q8K2Y9 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccm2Q8K2Y9 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccm2Q8K2Y9 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccm2Q8K2Y9 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccm2Q8K2Y9 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccm2Q8K2Y9 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccm2Q8K2Y9 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccm2Q8K2Y9 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccm2Q8K2Y9 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccm2Q8K2Y9 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccm2Q8K2Y9 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccm2Q8K2Y9 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccm2Q8K2Y9 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccm2Q8K2Y9 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccm2Q8K2Y9 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccm2Q8K2Y9 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccm2Q8K2Y9 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccm2Q8K2Y9 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccm2Q8K2Y9 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccm2Q8K2Y9 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccm2Q8K2Y9 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.4 ms