Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIT9

Sbsn, Suprabasin, mousemouse

Predictions only

Length 700 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbsnQ8CIT9 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
SbsnQ8CIT9 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
SbsnQ8CIT9 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
SbsnQ8CIT9 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
SbsnQ8CIT9 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
SbsnQ8CIT9 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
SbsnQ8CIT9 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
SbsnQ8CIT9 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
SbsnQ8CIT9 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
SbsnQ8CIT9 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
SbsnQ8CIT9 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
SbsnQ8CIT9 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
SbsnQ8CIT9 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
SbsnQ8CIT9 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
SbsnQ8CIT9 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
SbsnQ8CIT9 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
SbsnQ8CIT9 Pbx1-205ENSMUST00000176540 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
SbsnQ8CIT9 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
SbsnQ8CIT9 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
SbsnQ8CIT9 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
SbsnQ8CIT9 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC11.47□□□□□ -0.57
SbsnQ8CIT9 Slc35e2-202ENSMUST00000105608 6291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
SbsnQ8CIT9 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
SbsnQ8CIT9 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
SbsnQ8CIT9 Clpb-211ENSMUST00000209579 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
SbsnQ8CIT9 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
SbsnQ8CIT9 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
SbsnQ8CIT9 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
SbsnQ8CIT9 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
SbsnQ8CIT9 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
SbsnQ8CIT9 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
SbsnQ8CIT9 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
SbsnQ8CIT9 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
SbsnQ8CIT9 Bicra-201ENSMUST00000094821 5360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
SbsnQ8CIT9 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
SbsnQ8CIT9 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
SbsnQ8CIT9 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
SbsnQ8CIT9 Gm37014-201ENSMUST00000194723 2253 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
SbsnQ8CIT9 Eps15l1-201ENSMUST00000163643 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
SbsnQ8CIT9 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
SbsnQ8CIT9 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
SbsnQ8CIT9 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
SbsnQ8CIT9 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
SbsnQ8CIT9 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
SbsnQ8CIT9 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
SbsnQ8CIT9 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
SbsnQ8CIT9 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
SbsnQ8CIT9 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
SbsnQ8CIT9 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
SbsnQ8CIT9 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
SbsnQ8CIT9 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
SbsnQ8CIT9 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
SbsnQ8CIT9 Eogt-201ENSMUST00000054344 4424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
SbsnQ8CIT9 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
SbsnQ8CIT9 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
SbsnQ8CIT9 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
SbsnQ8CIT9 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
SbsnQ8CIT9 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
SbsnQ8CIT9 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
SbsnQ8CIT9 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
SbsnQ8CIT9 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
SbsnQ8CIT9 Plet1-201ENSMUST00000114474 1689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
SbsnQ8CIT9 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
SbsnQ8CIT9 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
SbsnQ8CIT9 St6galnac6-201ENSMUST00000072111 2277 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
SbsnQ8CIT9 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
SbsnQ8CIT9 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
SbsnQ8CIT9 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
SbsnQ8CIT9 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
SbsnQ8CIT9 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
SbsnQ8CIT9 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
SbsnQ8CIT9 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC11.45□□□□□ -0.58
SbsnQ8CIT9 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
SbsnQ8CIT9 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
SbsnQ8CIT9 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
SbsnQ8CIT9 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
SbsnQ8CIT9 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
SbsnQ8CIT9 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
SbsnQ8CIT9 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
SbsnQ8CIT9 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
SbsnQ8CIT9 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
SbsnQ8CIT9 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
SbsnQ8CIT9 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
SbsnQ8CIT9 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
SbsnQ8CIT9 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
SbsnQ8CIT9 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
SbsnQ8CIT9 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
SbsnQ8CIT9 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
SbsnQ8CIT9 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
SbsnQ8CIT9 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
SbsnQ8CIT9 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
SbsnQ8CIT9 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
SbsnQ8CIT9 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC11.45□□□□□ -0.58
SbsnQ8CIT9 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
SbsnQ8CIT9 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
SbsnQ8CIT9 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
SbsnQ8CIT9 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
SbsnQ8CIT9 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
SbsnQ8CIT9 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
SbsnQ8CIT9 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.5 ms