Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGV9

Tshz3, Teashirt homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,081 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tshz3Q8CGV9 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tshz3Q8CGV9 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Tshz3Q8CGV9 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tshz3Q8CGV9 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Tshz3Q8CGV9 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tshz3Q8CGV9 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tshz3Q8CGV9 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tshz3Q8CGV9 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tshz3Q8CGV9 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tshz3Q8CGV9 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tshz3Q8CGV9 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tshz3Q8CGV9 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tshz3Q8CGV9 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tshz3Q8CGV9 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tshz3Q8CGV9 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tshz3Q8CGV9 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tshz3Q8CGV9 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tshz3Q8CGV9 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tshz3Q8CGV9 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tshz3Q8CGV9 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tshz3Q8CGV9 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tshz3Q8CGV9 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tshz3Q8CGV9 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tshz3Q8CGV9 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tshz3Q8CGV9 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tshz3Q8CGV9 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tshz3Q8CGV9 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tshz3Q8CGV9 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tshz3Q8CGV9 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Tshz3Q8CGV9 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Tshz3Q8CGV9 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tshz3Q8CGV9 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tshz3Q8CGV9 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tshz3Q8CGV9 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Tshz3Q8CGV9 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tshz3Q8CGV9 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tshz3Q8CGV9 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tshz3Q8CGV9 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tshz3Q8CGV9 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tshz3Q8CGV9 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tshz3Q8CGV9 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tshz3Q8CGV9 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tshz3Q8CGV9 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tshz3Q8CGV9 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tshz3Q8CGV9 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tshz3Q8CGV9 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tshz3Q8CGV9 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tshz3Q8CGV9 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tshz3Q8CGV9 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tshz3Q8CGV9 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Tshz3Q8CGV9 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tshz3Q8CGV9 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tshz3Q8CGV9 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tshz3Q8CGV9 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tshz3Q8CGV9 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tshz3Q8CGV9 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tshz3Q8CGV9 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Tshz3Q8CGV9 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Tshz3Q8CGV9 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tshz3Q8CGV9 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Tshz3Q8CGV9 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Tshz3Q8CGV9 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tshz3Q8CGV9 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tshz3Q8CGV9 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tshz3Q8CGV9 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tshz3Q8CGV9 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tshz3Q8CGV9 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tshz3Q8CGV9 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tshz3Q8CGV9 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Tshz3Q8CGV9 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tshz3Q8CGV9 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tshz3Q8CGV9 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tshz3Q8CGV9 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tshz3Q8CGV9 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Tshz3Q8CGV9 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tshz3Q8CGV9 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Tshz3Q8CGV9 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tshz3Q8CGV9 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tshz3Q8CGV9 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tshz3Q8CGV9 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tshz3Q8CGV9 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Tshz3Q8CGV9 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tshz3Q8CGV9 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Tshz3Q8CGV9 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tshz3Q8CGV9 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tshz3Q8CGV9 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tshz3Q8CGV9 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tshz3Q8CGV9 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tshz3Q8CGV9 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tshz3Q8CGV9 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tshz3Q8CGV9 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Tshz3Q8CGV9 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tshz3Q8CGV9 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tshz3Q8CGV9 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tshz3Q8CGV9 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Tshz3Q8CGV9 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tshz3Q8CGV9 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Tshz3Q8CGV9 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tshz3Q8CGV9 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tshz3Q8CGV9 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms