Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFD5

Ercc8, DNA excision repair protein ERCC-8, mousemouse

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Length 397 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc8Q8CFD5 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ercc8Q8CFD5 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ercc8Q8CFD5 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Ercc8Q8CFD5 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Ercc8Q8CFD5 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ercc8Q8CFD5 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ercc8Q8CFD5 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ercc8Q8CFD5 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
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Ercc8Q8CFD5 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ercc8Q8CFD5 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ercc8Q8CFD5 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ercc8Q8CFD5 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ercc8Q8CFD5 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ercc8Q8CFD5 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ercc8Q8CFD5 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ercc8Q8CFD5 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ercc8Q8CFD5 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ercc8Q8CFD5 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Ercc8Q8CFD5 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Ercc8Q8CFD5 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ercc8Q8CFD5 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Ercc8Q8CFD5 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Ercc8Q8CFD5 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ercc8Q8CFD5 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ercc8Q8CFD5 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ercc8Q8CFD5 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Ercc8Q8CFD5 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Ercc8Q8CFD5 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ercc8Q8CFD5 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Ercc8Q8CFD5 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ercc8Q8CFD5 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ercc8Q8CFD5 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ercc8Q8CFD5 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Ercc8Q8CFD5 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ercc8Q8CFD5 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Ercc8Q8CFD5 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ercc8Q8CFD5 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ercc8Q8CFD5 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Ercc8Q8CFD5 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Ercc8Q8CFD5 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ercc8Q8CFD5 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ercc8Q8CFD5 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ercc8Q8CFD5 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Ercc8Q8CFD5 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ercc8Q8CFD5 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ercc8Q8CFD5 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ercc8Q8CFD5 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ercc8Q8CFD5 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ercc8Q8CFD5 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ercc8Q8CFD5 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ercc8Q8CFD5 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Ercc8Q8CFD5 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Ercc8Q8CFD5 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ercc8Q8CFD5 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Ercc8Q8CFD5 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ercc8Q8CFD5 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ercc8Q8CFD5 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Ercc8Q8CFD5 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ercc8Q8CFD5 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Ercc8Q8CFD5 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ercc8Q8CFD5 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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