Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDM1

Atad2, ATPase family AAA domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,040 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atad2Q8CDM1 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atad2Q8CDM1 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atad2Q8CDM1 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atad2Q8CDM1 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atad2Q8CDM1 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atad2Q8CDM1 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atad2Q8CDM1 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atad2Q8CDM1 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atad2Q8CDM1 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atad2Q8CDM1 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atad2Q8CDM1 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atad2Q8CDM1 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atad2Q8CDM1 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atad2Q8CDM1 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atad2Q8CDM1 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atad2Q8CDM1 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atad2Q8CDM1 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atad2Q8CDM1 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atad2Q8CDM1 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Atad2Q8CDM1 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atad2Q8CDM1 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atad2Q8CDM1 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atad2Q8CDM1 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atad2Q8CDM1 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atad2Q8CDM1 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atad2Q8CDM1 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atad2Q8CDM1 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atad2Q8CDM1 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atad2Q8CDM1 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Atad2Q8CDM1 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Atad2Q8CDM1 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atad2Q8CDM1 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atad2Q8CDM1 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atad2Q8CDM1 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atad2Q8CDM1 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atad2Q8CDM1 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atad2Q8CDM1 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atad2Q8CDM1 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atad2Q8CDM1 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atad2Q8CDM1 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atad2Q8CDM1 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atad2Q8CDM1 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atad2Q8CDM1 Olfr1038-ps-201ENSMUST00000149775 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atad2Q8CDM1 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atad2Q8CDM1 Gm15940-201ENSMUST00000156011 817 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atad2Q8CDM1 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atad2Q8CDM1 Gm37638-201ENSMUST00000194337 1123 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Atad2Q8CDM1 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atad2Q8CDM1 AC153932.1-201ENSMUST00000218558 787 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Atad2Q8CDM1 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atad2Q8CDM1 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Atad2Q8CDM1 Tnfsf9-201ENSMUST00000039490 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atad2Q8CDM1 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Atad2Q8CDM1 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atad2Q8CDM1 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atad2Q8CDM1 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atad2Q8CDM1 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atad2Q8CDM1 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atad2Q8CDM1 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atad2Q8CDM1 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atad2Q8CDM1 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atad2Q8CDM1 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atad2Q8CDM1 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atad2Q8CDM1 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atad2Q8CDM1 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atad2Q8CDM1 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atad2Q8CDM1 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atad2Q8CDM1 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atad2Q8CDM1 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atad2Q8CDM1 Gm37648-201ENSMUST00000192072 2563 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Atad2Q8CDM1 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atad2Q8CDM1 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atad2Q8CDM1 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atad2Q8CDM1 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atad2Q8CDM1 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atad2Q8CDM1 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atad2Q8CDM1 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Atad2Q8CDM1 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atad2Q8CDM1 Olfr886-ps1-201ENSMUST00000212395 708 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Atad2Q8CDM1 4930550C14Rik-204ENSMUST00000217318 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atad2Q8CDM1 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atad2Q8CDM1 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atad2Q8CDM1 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Atad2Q8CDM1 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atad2Q8CDM1 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Atad2Q8CDM1 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atad2Q8CDM1 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atad2Q8CDM1 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atad2Q8CDM1 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atad2Q8CDM1 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atad2Q8CDM1 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atad2Q8CDM1 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atad2Q8CDM1 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atad2Q8CDM1 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atad2Q8CDM1 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atad2Q8CDM1 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atad2Q8CDM1 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Atad2Q8CDM1 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Atad2Q8CDM1 Tnf-201ENSMUST00000025263 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atad2Q8CDM1 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.6 ms