Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCE9

E4f1, Transcription factor E4F1, mousemouse

Predictions only

Length 783 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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E4f1Q8CCE9 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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E4f1Q8CCE9 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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E4f1Q8CCE9 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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E4f1Q8CCE9 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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E4f1Q8CCE9 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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E4f1Q8CCE9 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
E4f1Q8CCE9 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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E4f1Q8CCE9 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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E4f1Q8CCE9 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
E4f1Q8CCE9 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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E4f1Q8CCE9 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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E4f1Q8CCE9 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
E4f1Q8CCE9 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
E4f1Q8CCE9 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.8 ms