Protein–RNA interactions for Protein: Q8CAT8

Fbxo48, F-box only protein 48, mousemouse

Predictions only

Length 161 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbxo48Q8CAT8 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Fbxo48Q8CAT8 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Fbxo48Q8CAT8 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Fbxo48Q8CAT8 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Fbxo48Q8CAT8 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Fbxo48Q8CAT8 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Fbxo48Q8CAT8 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Fbxo48Q8CAT8 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Fbxo48Q8CAT8 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Fbxo48Q8CAT8 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Fbxo48Q8CAT8 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Fbxo48Q8CAT8 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Fbxo48Q8CAT8 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Fbxo48Q8CAT8 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Fbxo48Q8CAT8 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Fbxo48Q8CAT8 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Fbxo48Q8CAT8 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Fbxo48Q8CAT8 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Fbxo48Q8CAT8 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Fbxo48Q8CAT8 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Fbxo48Q8CAT8 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Fbxo48Q8CAT8 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Fbxo48Q8CAT8 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Fbxo48Q8CAT8 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Fbxo48Q8CAT8 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Fbxo48Q8CAT8 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Fbxo48Q8CAT8 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Fbxo48Q8CAT8 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Fbxo48Q8CAT8 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Fbxo48Q8CAT8 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Fbxo48Q8CAT8 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Fbxo48Q8CAT8 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Fbxo48Q8CAT8 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Fbxo48Q8CAT8 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Fbxo48Q8CAT8 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Fbxo48Q8CAT8 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Fbxo48Q8CAT8 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Fbxo48Q8CAT8 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Fbxo48Q8CAT8 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Fbxo48Q8CAT8 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Fbxo48Q8CAT8 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Fbxo48Q8CAT8 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Fbxo48Q8CAT8 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Fbxo48Q8CAT8 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Fbxo48Q8CAT8 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Fbxo48Q8CAT8 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Fbxo48Q8CAT8 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Fbxo48Q8CAT8 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Fbxo48Q8CAT8 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Fbxo48Q8CAT8 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Fbxo48Q8CAT8 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Fbxo48Q8CAT8 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Fbxo48Q8CAT8 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Fbxo48Q8CAT8 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Fbxo48Q8CAT8 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Fbxo48Q8CAT8 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Fbxo48Q8CAT8 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Fbxo48Q8CAT8 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Fbxo48Q8CAT8 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Fbxo48Q8CAT8 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Fbxo48Q8CAT8 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Fbxo48Q8CAT8 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Fbxo48Q8CAT8 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Fbxo48Q8CAT8 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Fbxo48Q8CAT8 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Fbxo48Q8CAT8 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Fbxo48Q8CAT8 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Fbxo48Q8CAT8 Gm4959-201ENSMUST00000197271 1044 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Fbxo48Q8CAT8 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Fbxo48Q8CAT8 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Fbxo48Q8CAT8 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Fbxo48Q8CAT8 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Fbxo48Q8CAT8 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Fbxo48Q8CAT8 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Fbxo48Q8CAT8 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Fbxo48Q8CAT8 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Fbxo48Q8CAT8 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Fbxo48Q8CAT8 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Fbxo48Q8CAT8 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Fbxo48Q8CAT8 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Fbxo48Q8CAT8 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Fbxo48Q8CAT8 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Fbxo48Q8CAT8 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Fbxo48Q8CAT8 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Fbxo48Q8CAT8 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Fbxo48Q8CAT8 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Fbxo48Q8CAT8 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Fbxo48Q8CAT8 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Fbxo48Q8CAT8 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Fbxo48Q8CAT8 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Fbxo48Q8CAT8 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Fbxo48Q8CAT8 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Fbxo48Q8CAT8 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Fbxo48Q8CAT8 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
Fbxo48Q8CAT8 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Fbxo48Q8CAT8 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Fbxo48Q8CAT8 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Fbxo48Q8CAT8 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Fbxo48Q8CAT8 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Fbxo48Q8CAT8 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.3 ms