Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5V8

Ccdc187, Coiled-coil domain-containing protein 187, mousemouse

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Length 958 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc187Q8C5V8 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc187Q8C5V8 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc187Q8C5V8 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc187Q8C5V8 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc187Q8C5V8 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc187Q8C5V8 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc187Q8C5V8 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc187Q8C5V8 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc187Q8C5V8 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc187Q8C5V8 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc187Q8C5V8 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc187Q8C5V8 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc187Q8C5V8 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc187Q8C5V8 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc187Q8C5V8 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc187Q8C5V8 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Ccdc187Q8C5V8 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc187Q8C5V8 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Ccdc187Q8C5V8 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc187Q8C5V8 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
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Ccdc187Q8C5V8 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Ccdc187Q8C5V8 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc187Q8C5V8 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc187Q8C5V8 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc187Q8C5V8 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc187Q8C5V8 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc187Q8C5V8 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Ccdc187Q8C5V8 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc187Q8C5V8 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Ccdc187Q8C5V8 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc187Q8C5V8 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc187Q8C5V8 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Ccdc187Q8C5V8 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Ccdc187Q8C5V8 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc187Q8C5V8 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc187Q8C5V8 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc187Q8C5V8 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc187Q8C5V8 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Ccdc187Q8C5V8 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc187Q8C5V8 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc187Q8C5V8 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc187Q8C5V8 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc187Q8C5V8 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc187Q8C5V8 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Ccdc187Q8C5V8 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc187Q8C5V8 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Ccdc187Q8C5V8 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc187Q8C5V8 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc187Q8C5V8 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc187Q8C5V8 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc187Q8C5V8 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc187Q8C5V8 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc187Q8C5V8 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc187Q8C5V8 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc187Q8C5V8 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc187Q8C5V8 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Ccdc187Q8C5V8 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc187Q8C5V8 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc187Q8C5V8 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc187Q8C5V8 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc187Q8C5V8 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc187Q8C5V8 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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