Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0Q4

Nek11, Serine/threonine-protein kinase Nek11, mousemouse

Predictions only

Length 628 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek11Q8C0Q4 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nek11Q8C0Q4 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nek11Q8C0Q4 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nek11Q8C0Q4 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nek11Q8C0Q4 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nek11Q8C0Q4 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nek11Q8C0Q4 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nek11Q8C0Q4 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nek11Q8C0Q4 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nek11Q8C0Q4 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nek11Q8C0Q4 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nek11Q8C0Q4 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nek11Q8C0Q4 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nek11Q8C0Q4 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nek11Q8C0Q4 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nek11Q8C0Q4 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Nek11Q8C0Q4 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nek11Q8C0Q4 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nek11Q8C0Q4 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nek11Q8C0Q4 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nek11Q8C0Q4 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nek11Q8C0Q4 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nek11Q8C0Q4 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nek11Q8C0Q4 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nek11Q8C0Q4 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nek11Q8C0Q4 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nek11Q8C0Q4 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nek11Q8C0Q4 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nek11Q8C0Q4 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nek11Q8C0Q4 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nek11Q8C0Q4 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nek11Q8C0Q4 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Nek11Q8C0Q4 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Nek11Q8C0Q4 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nek11Q8C0Q4 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nek11Q8C0Q4 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nek11Q8C0Q4 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nek11Q8C0Q4 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nek11Q8C0Q4 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nek11Q8C0Q4 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nek11Q8C0Q4 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Nek11Q8C0Q4 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nek11Q8C0Q4 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nek11Q8C0Q4 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nek11Q8C0Q4 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nek11Q8C0Q4 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nek11Q8C0Q4 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nek11Q8C0Q4 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nek11Q8C0Q4 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nek11Q8C0Q4 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nek11Q8C0Q4 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nek11Q8C0Q4 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Nek11Q8C0Q4 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nek11Q8C0Q4 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nek11Q8C0Q4 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nek11Q8C0Q4 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nek11Q8C0Q4 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nek11Q8C0Q4 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nek11Q8C0Q4 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nek11Q8C0Q4 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nek11Q8C0Q4 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nek11Q8C0Q4 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nek11Q8C0Q4 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nek11Q8C0Q4 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nek11Q8C0Q4 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nek11Q8C0Q4 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nek11Q8C0Q4 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nek11Q8C0Q4 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nek11Q8C0Q4 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nek11Q8C0Q4 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nek11Q8C0Q4 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nek11Q8C0Q4 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nek11Q8C0Q4 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nek11Q8C0Q4 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nek11Q8C0Q4 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nek11Q8C0Q4 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nek11Q8C0Q4 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nek11Q8C0Q4 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nek11Q8C0Q4 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nek11Q8C0Q4 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Nek11Q8C0Q4 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nek11Q8C0Q4 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nek11Q8C0Q4 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nek11Q8C0Q4 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Nek11Q8C0Q4 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nek11Q8C0Q4 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nek11Q8C0Q4 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nek11Q8C0Q4 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nek11Q8C0Q4 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nek11Q8C0Q4 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nek11Q8C0Q4 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Nek11Q8C0Q4 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nek11Q8C0Q4 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nek11Q8C0Q4 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nek11Q8C0Q4 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nek11Q8C0Q4 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nek11Q8C0Q4 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nek11Q8C0Q4 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nek11Q8C0Q4 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nek11Q8C0Q4 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.2 ms