Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0J2

Atg16l1, Autophagy-related protein 16-1, mousemouse

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Length 607 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg16l1Q8C0J2 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Atg16l1Q8C0J2 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Atg16l1Q8C0J2 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Atg16l1Q8C0J2 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Atg16l1Q8C0J2 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Atg16l1Q8C0J2 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Atg16l1Q8C0J2 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Atg16l1Q8C0J2 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Atg16l1Q8C0J2 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Atg16l1Q8C0J2 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Atg16l1Q8C0J2 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Atg16l1Q8C0J2 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Atg16l1Q8C0J2 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Atg16l1Q8C0J2 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Atg16l1Q8C0J2 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Atg16l1Q8C0J2 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Atg16l1Q8C0J2 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Atg16l1Q8C0J2 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
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Atg16l1Q8C0J2 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Atg16l1Q8C0J2 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Atg16l1Q8C0J2 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Atg16l1Q8C0J2 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Atg16l1Q8C0J2 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Atg16l1Q8C0J2 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
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Atg16l1Q8C0J2 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Atg16l1Q8C0J2 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Atg16l1Q8C0J2 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Atg16l1Q8C0J2 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Atg16l1Q8C0J2 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Atg16l1Q8C0J2 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Atg16l1Q8C0J2 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Atg16l1Q8C0J2 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Atg16l1Q8C0J2 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Atg16l1Q8C0J2 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Atg16l1Q8C0J2 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Atg16l1Q8C0J2 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Atg16l1Q8C0J2 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Atg16l1Q8C0J2 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Atg16l1Q8C0J2 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Atg16l1Q8C0J2 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Atg16l1Q8C0J2 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Atg16l1Q8C0J2 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Atg16l1Q8C0J2 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Atg16l1Q8C0J2 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Atg16l1Q8C0J2 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Atg16l1Q8C0J2 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Atg16l1Q8C0J2 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
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Atg16l1Q8C0J2 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
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Atg16l1Q8C0J2 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Atg16l1Q8C0J2 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Atg16l1Q8C0J2 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
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Atg16l1Q8C0J2 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
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Atg16l1Q8C0J2 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Atg16l1Q8C0J2 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Atg16l1Q8C0J2 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Atg16l1Q8C0J2 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Atg16l1Q8C0J2 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Atg16l1Q8C0J2 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Atg16l1Q8C0J2 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Atg16l1Q8C0J2 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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Atg16l1Q8C0J2 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Atg16l1Q8C0J2 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Atg16l1Q8C0J2 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Atg16l1Q8C0J2 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Atg16l1Q8C0J2 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Atg16l1Q8C0J2 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Atg16l1Q8C0J2 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Atg16l1Q8C0J2 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Atg16l1Q8C0J2 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Atg16l1Q8C0J2 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Atg16l1Q8C0J2 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Atg16l1Q8C0J2 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Atg16l1Q8C0J2 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Atg16l1Q8C0J2 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Atg16l1Q8C0J2 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Atg16l1Q8C0J2 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Atg16l1Q8C0J2 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Atg16l1Q8C0J2 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Atg16l1Q8C0J2 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Atg16l1Q8C0J2 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Atg16l1Q8C0J2 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Atg16l1Q8C0J2 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Atg16l1Q8C0J2 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Atg16l1Q8C0J2 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Atg16l1Q8C0J2 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Atg16l1Q8C0J2 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Atg16l1Q8C0J2 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Atg16l1Q8C0J2 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Atg16l1Q8C0J2 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Atg16l1Q8C0J2 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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