Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0C4

Ccser1, Serine-rich coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 895 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccser1Q8C0C4 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccser1Q8C0C4 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccser1Q8C0C4 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccser1Q8C0C4 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccser1Q8C0C4 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccser1Q8C0C4 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccser1Q8C0C4 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccser1Q8C0C4 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccser1Q8C0C4 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccser1Q8C0C4 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccser1Q8C0C4 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccser1Q8C0C4 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccser1Q8C0C4 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccser1Q8C0C4 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccser1Q8C0C4 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccser1Q8C0C4 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccser1Q8C0C4 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccser1Q8C0C4 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccser1Q8C0C4 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccser1Q8C0C4 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccser1Q8C0C4 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccser1Q8C0C4 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccser1Q8C0C4 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccser1Q8C0C4 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccser1Q8C0C4 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccser1Q8C0C4 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccser1Q8C0C4 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccser1Q8C0C4 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccser1Q8C0C4 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccser1Q8C0C4 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccser1Q8C0C4 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccser1Q8C0C4 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccser1Q8C0C4 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccser1Q8C0C4 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccser1Q8C0C4 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccser1Q8C0C4 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccser1Q8C0C4 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccser1Q8C0C4 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccser1Q8C0C4 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccser1Q8C0C4 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccser1Q8C0C4 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccser1Q8C0C4 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccser1Q8C0C4 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccser1Q8C0C4 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccser1Q8C0C4 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccser1Q8C0C4 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccser1Q8C0C4 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccser1Q8C0C4 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccser1Q8C0C4 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccser1Q8C0C4 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccser1Q8C0C4 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccser1Q8C0C4 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccser1Q8C0C4 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccser1Q8C0C4 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccser1Q8C0C4 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccser1Q8C0C4 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccser1Q8C0C4 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccser1Q8C0C4 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccser1Q8C0C4 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccser1Q8C0C4 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccser1Q8C0C4 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccser1Q8C0C4 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccser1Q8C0C4 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccser1Q8C0C4 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccser1Q8C0C4 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccser1Q8C0C4 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccser1Q8C0C4 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccser1Q8C0C4 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccser1Q8C0C4 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccser1Q8C0C4 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccser1Q8C0C4 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
Ccser1Q8C0C4 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ccser1Q8C0C4 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ccser1Q8C0C4 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
Ccser1Q8C0C4 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ccser1Q8C0C4 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccser1Q8C0C4 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccser1Q8C0C4 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccser1Q8C0C4 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccser1Q8C0C4 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccser1Q8C0C4 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccser1Q8C0C4 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccser1Q8C0C4 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccser1Q8C0C4 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccser1Q8C0C4 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccser1Q8C0C4 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccser1Q8C0C4 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccser1Q8C0C4 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccser1Q8C0C4 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccser1Q8C0C4 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccser1Q8C0C4 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccser1Q8C0C4 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccser1Q8C0C4 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccser1Q8C0C4 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccser1Q8C0C4 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccser1Q8C0C4 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccser1Q8C0C4 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccser1Q8C0C4 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccser1Q8C0C4 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccser1Q8C0C4 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms