Protein–RNA interactions for Protein: Q8C006

Trim35, Tripartite motif-containing protein 35, mousemouse

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Length 501 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim35Q8C006 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trim35Q8C006 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trim35Q8C006 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trim35Q8C006 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trim35Q8C006 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trim35Q8C006 Gm43522-201ENSMUST00000196697 1922 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Trim35Q8C006 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trim35Q8C006 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trim35Q8C006 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trim35Q8C006 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Trim35Q8C006 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Trim35Q8C006 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trim35Q8C006 Cdh7-203ENSMUST00000129923 1409 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trim35Q8C006 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trim35Q8C006 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Trim35Q8C006 Dmrtc1b-203ENSMUST00000118842 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trim35Q8C006 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trim35Q8C006 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trim35Q8C006 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Trim35Q8C006 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trim35Q8C006 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trim35Q8C006 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trim35Q8C006 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trim35Q8C006 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trim35Q8C006 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trim35Q8C006 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trim35Q8C006 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trim35Q8C006 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Trim35Q8C006 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trim35Q8C006 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trim35Q8C006 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Trim35Q8C006 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trim35Q8C006 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trim35Q8C006 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Trim35Q8C006 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trim35Q8C006 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Trim35Q8C006 Tctex1d2-201ENSMUST00000014220 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trim35Q8C006 Gm11292-201ENSMUST00000146121 1153 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trim35Q8C006 Mocs2-205ENSMUST00000165022 962 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Trim35Q8C006 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trim35Q8C006 Rpl22l1-201ENSMUST00000043867 552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trim35Q8C006 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Trim35Q8C006 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trim35Q8C006 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trim35Q8C006 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trim35Q8C006 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trim35Q8C006 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trim35Q8C006 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trim35Q8C006 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trim35Q8C006 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trim35Q8C006 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trim35Q8C006 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trim35Q8C006 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trim35Q8C006 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trim35Q8C006 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trim35Q8C006 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trim35Q8C006 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trim35Q8C006 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trim35Q8C006 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trim35Q8C006 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
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