Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX07

Ctdsp2, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 2, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdsp2Q8BX07 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ctdsp2Q8BX07 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ctdsp2Q8BX07 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ctdsp2Q8BX07 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ctdsp2Q8BX07 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ctdsp2Q8BX07 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ctdsp2Q8BX07 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ctdsp2Q8BX07 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Ctdsp2Q8BX07 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Ctdsp2Q8BX07 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ctdsp2Q8BX07 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ctdsp2Q8BX07 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ctdsp2Q8BX07 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ctdsp2Q8BX07 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ctdsp2Q8BX07 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ctdsp2Q8BX07 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ctdsp2Q8BX07 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ctdsp2Q8BX07 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ctdsp2Q8BX07 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ctdsp2Q8BX07 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ctdsp2Q8BX07 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ctdsp2Q8BX07 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ctdsp2Q8BX07 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ctdsp2Q8BX07 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ctdsp2Q8BX07 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Ctdsp2Q8BX07 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ctdsp2Q8BX07 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ctdsp2Q8BX07 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ctdsp2Q8BX07 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ctdsp2Q8BX07 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ctdsp2Q8BX07 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Ctdsp2Q8BX07 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ctdsp2Q8BX07 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ctdsp2Q8BX07 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Ctdsp2Q8BX07 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ctdsp2Q8BX07 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ctdsp2Q8BX07 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ctdsp2Q8BX07 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Ctdsp2Q8BX07 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ctdsp2Q8BX07 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ctdsp2Q8BX07 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ctdsp2Q8BX07 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Ctdsp2Q8BX07 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ctdsp2Q8BX07 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ctdsp2Q8BX07 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Ctdsp2Q8BX07 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ctdsp2Q8BX07 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ctdsp2Q8BX07 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ctdsp2Q8BX07 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ctdsp2Q8BX07 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ctdsp2Q8BX07 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ctdsp2Q8BX07 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ctdsp2Q8BX07 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ctdsp2Q8BX07 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ctdsp2Q8BX07 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ctdsp2Q8BX07 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ctdsp2Q8BX07 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ctdsp2Q8BX07 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ctdsp2Q8BX07 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ctdsp2Q8BX07 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ctdsp2Q8BX07 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ctdsp2Q8BX07 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ctdsp2Q8BX07 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ctdsp2Q8BX07 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ctdsp2Q8BX07 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ctdsp2Q8BX07 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ctdsp2Q8BX07 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ctdsp2Q8BX07 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ctdsp2Q8BX07 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ctdsp2Q8BX07 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ctdsp2Q8BX07 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Ctdsp2Q8BX07 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ctdsp2Q8BX07 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ctdsp2Q8BX07 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ctdsp2Q8BX07 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ctdsp2Q8BX07 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ctdsp2Q8BX07 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ctdsp2Q8BX07 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ctdsp2Q8BX07 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ctdsp2Q8BX07 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ctdsp2Q8BX07 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ctdsp2Q8BX07 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ctdsp2Q8BX07 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ctdsp2Q8BX07 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ctdsp2Q8BX07 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ctdsp2Q8BX07 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ctdsp2Q8BX07 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ctdsp2Q8BX07 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ctdsp2Q8BX07 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ctdsp2Q8BX07 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Ctdsp2Q8BX07 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Ctdsp2Q8BX07 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Ctdsp2Q8BX07 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Ctdsp2Q8BX07 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Ctdsp2Q8BX07 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Ctdsp2Q8BX07 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Ctdsp2Q8BX07 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Ctdsp2Q8BX07 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Ctdsp2Q8BX07 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Ctdsp2Q8BX07 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.7 ms