Protein–RNA interactions for Protein: Q8BV13

Cops7b, COP9 signalosome complex subunit 7b, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cops7bQ8BV13 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cops7bQ8BV13 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cops7bQ8BV13 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cops7bQ8BV13 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cops7bQ8BV13 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Cops7bQ8BV13 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Cops7bQ8BV13 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cops7bQ8BV13 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cops7bQ8BV13 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cops7bQ8BV13 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cops7bQ8BV13 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cops7bQ8BV13 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cops7bQ8BV13 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cops7bQ8BV13 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cops7bQ8BV13 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cops7bQ8BV13 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cops7bQ8BV13 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Cops7bQ8BV13 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cops7bQ8BV13 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cops7bQ8BV13 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cops7bQ8BV13 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cops7bQ8BV13 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cops7bQ8BV13 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cops7bQ8BV13 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cops7bQ8BV13 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cops7bQ8BV13 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cops7bQ8BV13 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Cops7bQ8BV13 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Cops7bQ8BV13 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.27
Cops7bQ8BV13 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Cops7bQ8BV13 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cops7bQ8BV13 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cops7bQ8BV13 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cops7bQ8BV13 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cops7bQ8BV13 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cops7bQ8BV13 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cops7bQ8BV13 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cops7bQ8BV13 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cops7bQ8BV13 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cops7bQ8BV13 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cops7bQ8BV13 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cops7bQ8BV13 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cops7bQ8BV13 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cops7bQ8BV13 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Cops7bQ8BV13 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Cops7bQ8BV13 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cops7bQ8BV13 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Cops7bQ8BV13 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cops7bQ8BV13 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cops7bQ8BV13 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cops7bQ8BV13 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cops7bQ8BV13 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cops7bQ8BV13 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cops7bQ8BV13 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cops7bQ8BV13 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cops7bQ8BV13 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cops7bQ8BV13 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cops7bQ8BV13 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cops7bQ8BV13 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cops7bQ8BV13 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cops7bQ8BV13 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cops7bQ8BV13 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cops7bQ8BV13 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Cops7bQ8BV13 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cops7bQ8BV13 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cops7bQ8BV13 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cops7bQ8BV13 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cops7bQ8BV13 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cops7bQ8BV13 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cops7bQ8BV13 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cops7bQ8BV13 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cops7bQ8BV13 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cops7bQ8BV13 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cops7bQ8BV13 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cops7bQ8BV13 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cops7bQ8BV13 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cops7bQ8BV13 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Cops7bQ8BV13 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Cops7bQ8BV13 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cops7bQ8BV13 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cops7bQ8BV13 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cops7bQ8BV13 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cops7bQ8BV13 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cops7bQ8BV13 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cops7bQ8BV13 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cops7bQ8BV13 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cops7bQ8BV13 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cops7bQ8BV13 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cops7bQ8BV13 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cops7bQ8BV13 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cops7bQ8BV13 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cops7bQ8BV13 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cops7bQ8BV13 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cops7bQ8BV13 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cops7bQ8BV13 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cops7bQ8BV13 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cops7bQ8BV13 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cops7bQ8BV13 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cops7bQ8BV13 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cops7bQ8BV13 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms