Protein–RNA interactions for Protein: Q8BH01

Tmco3, Transmembrane and coiled-coil domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 678 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmco3Q8BH01 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmco3Q8BH01 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmco3Q8BH01 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmco3Q8BH01 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmco3Q8BH01 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmco3Q8BH01 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmco3Q8BH01 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmco3Q8BH01 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmco3Q8BH01 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmco3Q8BH01 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmco3Q8BH01 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmco3Q8BH01 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmco3Q8BH01 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmco3Q8BH01 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tmco3Q8BH01 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tmco3Q8BH01 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tmco3Q8BH01 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Tmco3Q8BH01 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tmco3Q8BH01 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Tmco3Q8BH01 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tmco3Q8BH01 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Tmco3Q8BH01 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Tmco3Q8BH01 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Tmco3Q8BH01 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Tmco3Q8BH01 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Tmco3Q8BH01 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tmco3Q8BH01 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Tmco3Q8BH01 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tmco3Q8BH01 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tmco3Q8BH01 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tmco3Q8BH01 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Tmco3Q8BH01 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Tmco3Q8BH01 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tmco3Q8BH01 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tmco3Q8BH01 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tmco3Q8BH01 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tmco3Q8BH01 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tmco3Q8BH01 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Tmco3Q8BH01 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tmco3Q8BH01 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Tmco3Q8BH01 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tmco3Q8BH01 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Tmco3Q8BH01 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tmco3Q8BH01 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tmco3Q8BH01 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tmco3Q8BH01 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Tmco3Q8BH01 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tmco3Q8BH01 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tmco3Q8BH01 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tmco3Q8BH01 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Tmco3Q8BH01 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tmco3Q8BH01 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tmco3Q8BH01 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tmco3Q8BH01 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmco3Q8BH01 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmco3Q8BH01 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmco3Q8BH01 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmco3Q8BH01 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmco3Q8BH01 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmco3Q8BH01 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tmco3Q8BH01 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Tmco3Q8BH01 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Tmco3Q8BH01 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tmco3Q8BH01 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmco3Q8BH01 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmco3Q8BH01 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tmco3Q8BH01 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmco3Q8BH01 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmco3Q8BH01 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmco3Q8BH01 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tmco3Q8BH01 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmco3Q8BH01 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmco3Q8BH01 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmco3Q8BH01 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Tmco3Q8BH01 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmco3Q8BH01 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmco3Q8BH01 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmco3Q8BH01 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Tmco3Q8BH01 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmco3Q8BH01 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmco3Q8BH01 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmco3Q8BH01 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Tmco3Q8BH01 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmco3Q8BH01 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmco3Q8BH01 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tmco3Q8BH01 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Tmco3Q8BH01 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Tmco3Q8BH01 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmco3Q8BH01 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tmco3Q8BH01 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmco3Q8BH01 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmco3Q8BH01 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmco3Q8BH01 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmco3Q8BH01 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmco3Q8BH01 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmco3Q8BH01 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmco3Q8BH01 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmco3Q8BH01 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmco3Q8BH01 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmco3Q8BH01 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms