Protein–RNA interactions for Protein: Q810U5

Ccdc50, Coiled-coil domain-containing protein 50, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc50Q810U5 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc50Q810U5 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc50Q810U5 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc50Q810U5 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc50Q810U5 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc50Q810U5 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc50Q810U5 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc50Q810U5 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc50Q810U5 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc50Q810U5 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc50Q810U5 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc50Q810U5 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc50Q810U5 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc50Q810U5 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc50Q810U5 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc50Q810U5 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc50Q810U5 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc50Q810U5 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc50Q810U5 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc50Q810U5 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc50Q810U5 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc50Q810U5 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc50Q810U5 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc50Q810U5 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc50Q810U5 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc50Q810U5 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc50Q810U5 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc50Q810U5 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc50Q810U5 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc50Q810U5 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc50Q810U5 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc50Q810U5 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc50Q810U5 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc50Q810U5 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc50Q810U5 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc50Q810U5 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc50Q810U5 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc50Q810U5 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc50Q810U5 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc50Q810U5 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc50Q810U5 Epb41l2-204ENSMUST00000217929 3621 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc50Q810U5 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc50Q810U5 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc50Q810U5 Grin1-205ENSMUST00000114312 3838 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc50Q810U5 Grin1-207ENSMUST00000114317 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc50Q810U5 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc50Q810U5 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc50Q810U5 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc50Q810U5 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc50Q810U5 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc50Q810U5 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc50Q810U5 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc50Q810U5 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc50Q810U5 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc50Q810U5 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc50Q810U5 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc50Q810U5 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc50Q810U5 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc50Q810U5 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc50Q810U5 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc50Q810U5 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc50Q810U5 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc50Q810U5 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc50Q810U5 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc50Q810U5 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc50Q810U5 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc50Q810U5 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc50Q810U5 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc50Q810U5 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc50Q810U5 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc50Q810U5 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc50Q810U5 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc50Q810U5 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc50Q810U5 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc50Q810U5 Mgat1-203ENSMUST00000109194 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc50Q810U5 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc50Q810U5 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc50Q810U5 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc50Q810U5 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc50Q810U5 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc50Q810U5 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc50Q810U5 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc50Q810U5 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc50Q810U5 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc50Q810U5 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc50Q810U5 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc50Q810U5 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc50Q810U5 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc50Q810U5 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc50Q810U5 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc50Q810U5 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc50Q810U5 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc50Q810U5 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc50Q810U5 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc50Q810U5 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc50Q810U5 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc50Q810U5 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc50Q810U5 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc50Q810U5 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc50Q810U5 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.3 ms