Protein–RNA interactions for Protein: Q810N9

Ccdc172, Coiled-coil domain-containing protein 172, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc172Q810N9 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc172Q810N9 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc172Q810N9 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc172Q810N9 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc172Q810N9 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc172Q810N9 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc172Q810N9 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc172Q810N9 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc172Q810N9 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc172Q810N9 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc172Q810N9 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc172Q810N9 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc172Q810N9 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc172Q810N9 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc172Q810N9 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc172Q810N9 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc172Q810N9 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc172Q810N9 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc172Q810N9 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc172Q810N9 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc172Q810N9 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc172Q810N9 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc172Q810N9 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc172Q810N9 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc172Q810N9 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc172Q810N9 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc172Q810N9 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc172Q810N9 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc172Q810N9 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc172Q810N9 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc172Q810N9 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc172Q810N9 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc172Q810N9 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc172Q810N9 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc172Q810N9 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc172Q810N9 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc172Q810N9 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc172Q810N9 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc172Q810N9 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc172Q810N9 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc172Q810N9 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc172Q810N9 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc172Q810N9 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc172Q810N9 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc172Q810N9 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc172Q810N9 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc172Q810N9 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc172Q810N9 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc172Q810N9 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc172Q810N9 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc172Q810N9 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc172Q810N9 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc172Q810N9 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc172Q810N9 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc172Q810N9 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc172Q810N9 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc172Q810N9 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc172Q810N9 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc172Q810N9 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc172Q810N9 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc172Q810N9 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc172Q810N9 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc172Q810N9 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc172Q810N9 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc172Q810N9 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc172Q810N9 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc172Q810N9 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc172Q810N9 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc172Q810N9 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc172Q810N9 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc172Q810N9 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc172Q810N9 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc172Q810N9 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc172Q810N9 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc172Q810N9 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc172Q810N9 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc172Q810N9 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc172Q810N9 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc172Q810N9 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc172Q810N9 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc172Q810N9 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc172Q810N9 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc172Q810N9 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc172Q810N9 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc172Q810N9 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc172Q810N9 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc172Q810N9 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc172Q810N9 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc172Q810N9 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc172Q810N9 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc172Q810N9 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc172Q810N9 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc172Q810N9 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc172Q810N9 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc172Q810N9 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc172Q810N9 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc172Q810N9 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc172Q810N9 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc172Q810N9 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc172Q810N9 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms