Protein–RNA interactions for Protein: Q810L3

Chfr, E3 ubiquitin-protein ligase CHFR, mousemouse

Predictions only

Length 664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChfrQ810L3 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ChfrQ810L3 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
ChfrQ810L3 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ChfrQ810L3 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ChfrQ810L3 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
ChfrQ810L3 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ChfrQ810L3 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ChfrQ810L3 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ChfrQ810L3 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
ChfrQ810L3 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
ChfrQ810L3 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
ChfrQ810L3 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
ChfrQ810L3 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
ChfrQ810L3 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
ChfrQ810L3 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
ChfrQ810L3 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
ChfrQ810L3 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
ChfrQ810L3 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
ChfrQ810L3 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
ChfrQ810L3 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
ChfrQ810L3 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
ChfrQ810L3 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
ChfrQ810L3 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
ChfrQ810L3 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
ChfrQ810L3 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
ChfrQ810L3 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
ChfrQ810L3 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
ChfrQ810L3 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
ChfrQ810L3 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
ChfrQ810L3 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
ChfrQ810L3 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
ChfrQ810L3 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
ChfrQ810L3 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
ChfrQ810L3 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
ChfrQ810L3 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
ChfrQ810L3 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
ChfrQ810L3 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
ChfrQ810L3 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
ChfrQ810L3 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
ChfrQ810L3 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
ChfrQ810L3 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
ChfrQ810L3 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
ChfrQ810L3 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
ChfrQ810L3 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
ChfrQ810L3 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
ChfrQ810L3 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
ChfrQ810L3 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
ChfrQ810L3 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ChfrQ810L3 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ChfrQ810L3 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ChfrQ810L3 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
ChfrQ810L3 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ChfrQ810L3 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ChfrQ810L3 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ChfrQ810L3 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ChfrQ810L3 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ChfrQ810L3 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ChfrQ810L3 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ChfrQ810L3 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
ChfrQ810L3 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
ChfrQ810L3 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
ChfrQ810L3 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
ChfrQ810L3 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
ChfrQ810L3 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
ChfrQ810L3 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
ChfrQ810L3 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ChfrQ810L3 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
ChfrQ810L3 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ChfrQ810L3 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ChfrQ810L3 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ChfrQ810L3 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ChfrQ810L3 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ChfrQ810L3 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
ChfrQ810L3 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ChfrQ810L3 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
ChfrQ810L3 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ChfrQ810L3 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
ChfrQ810L3 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ChfrQ810L3 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ChfrQ810L3 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
ChfrQ810L3 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ChfrQ810L3 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ChfrQ810L3 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ChfrQ810L3 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ChfrQ810L3 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ChfrQ810L3 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ChfrQ810L3 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ChfrQ810L3 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ChfrQ810L3 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ChfrQ810L3 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ChfrQ810L3 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ChfrQ810L3 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ChfrQ810L3 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ChfrQ810L3 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ChfrQ810L3 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ChfrQ810L3 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
ChfrQ810L3 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ChfrQ810L3 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
ChfrQ810L3 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ChfrQ810L3 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.5 ms