Protein–RNA interactions for Protein: Q80XU8

Lrfn4, Leucine-rich repeat and fibronectin type-III domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrfn4Q80XU8 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Lrfn4Q80XU8 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Lrfn4Q80XU8 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Lrfn4Q80XU8 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Lrfn4Q80XU8 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Lrfn4Q80XU8 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Lrfn4Q80XU8 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Lrfn4Q80XU8 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Lrfn4Q80XU8 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Lrfn4Q80XU8 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Lrfn4Q80XU8 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Lrfn4Q80XU8 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Lrfn4Q80XU8 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Lrfn4Q80XU8 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Lrfn4Q80XU8 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Lrfn4Q80XU8 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Lrfn4Q80XU8 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Lrfn4Q80XU8 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Lrfn4Q80XU8 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Lrfn4Q80XU8 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Lrfn4Q80XU8 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Lrfn4Q80XU8 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Lrfn4Q80XU8 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Lrfn4Q80XU8 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Lrfn4Q80XU8 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Lrfn4Q80XU8 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Lrfn4Q80XU8 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Lrfn4Q80XU8 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Lrfn4Q80XU8 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Lrfn4Q80XU8 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Lrfn4Q80XU8 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Lrfn4Q80XU8 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Lrfn4Q80XU8 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Lrfn4Q80XU8 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Lrfn4Q80XU8 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Lrfn4Q80XU8 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Lrfn4Q80XU8 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Lrfn4Q80XU8 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Lrfn4Q80XU8 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Lrfn4Q80XU8 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Lrfn4Q80XU8 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Lrfn4Q80XU8 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Lrfn4Q80XU8 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Lrfn4Q80XU8 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Lrfn4Q80XU8 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Lrfn4Q80XU8 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Lrfn4Q80XU8 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Lrfn4Q80XU8 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Lrfn4Q80XU8 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Lrfn4Q80XU8 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Lrfn4Q80XU8 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Lrfn4Q80XU8 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Lrfn4Q80XU8 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Lrfn4Q80XU8 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Lrfn4Q80XU8 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Lrfn4Q80XU8 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Lrfn4Q80XU8 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Lrfn4Q80XU8 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Lrfn4Q80XU8 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Lrfn4Q80XU8 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Lrfn4Q80XU8 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Lrfn4Q80XU8 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Lrfn4Q80XU8 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Lrfn4Q80XU8 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Lrfn4Q80XU8 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Lrfn4Q80XU8 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Lrfn4Q80XU8 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Lrfn4Q80XU8 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Lrfn4Q80XU8 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Lrfn4Q80XU8 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Lrfn4Q80XU8 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Lrfn4Q80XU8 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Lrfn4Q80XU8 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Lrfn4Q80XU8 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Lrfn4Q80XU8 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Lrfn4Q80XU8 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Lrfn4Q80XU8 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Lrfn4Q80XU8 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Lrfn4Q80XU8 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Lrfn4Q80XU8 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Lrfn4Q80XU8 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Lrfn4Q80XU8 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Lrfn4Q80XU8 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Lrfn4Q80XU8 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Lrfn4Q80XU8 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Lrfn4Q80XU8 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Lrfn4Q80XU8 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Lrfn4Q80XU8 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Lrfn4Q80XU8 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Lrfn4Q80XU8 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Lrfn4Q80XU8 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Lrfn4Q80XU8 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Lrfn4Q80XU8 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Lrfn4Q80XU8 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Lrfn4Q80XU8 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Lrfn4Q80XU8 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Lrfn4Q80XU8 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Lrfn4Q80XU8 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Lrfn4Q80XU8 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Lrfn4Q80XU8 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms