Protein–RNA interactions for Protein: Q80VM3

Ttc29, Tetratricopeptide repeat protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 471 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc29Q80VM3 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ttc29Q80VM3 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ttc29Q80VM3 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ttc29Q80VM3 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ttc29Q80VM3 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Ttc29Q80VM3 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Ttc29Q80VM3 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Ttc29Q80VM3 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Ttc29Q80VM3 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ttc29Q80VM3 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ttc29Q80VM3 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Ttc29Q80VM3 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ttc29Q80VM3 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ttc29Q80VM3 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ttc29Q80VM3 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ttc29Q80VM3 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Ttc29Q80VM3 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Ttc29Q80VM3 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Ttc29Q80VM3 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ttc29Q80VM3 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ttc29Q80VM3 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ttc29Q80VM3 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Ttc29Q80VM3 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ttc29Q80VM3 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Ttc29Q80VM3 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ttc29Q80VM3 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ttc29Q80VM3 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ttc29Q80VM3 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Ttc29Q80VM3 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ttc29Q80VM3 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ttc29Q80VM3 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Ttc29Q80VM3 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Ttc29Q80VM3 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Ttc29Q80VM3 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Ttc29Q80VM3 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Ttc29Q80VM3 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ttc29Q80VM3 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ttc29Q80VM3 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ttc29Q80VM3 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ttc29Q80VM3 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ttc29Q80VM3 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ttc29Q80VM3 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Ttc29Q80VM3 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ttc29Q80VM3 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ttc29Q80VM3 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ttc29Q80VM3 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ttc29Q80VM3 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ttc29Q80VM3 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ttc29Q80VM3 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ttc29Q80VM3 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ttc29Q80VM3 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ttc29Q80VM3 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ttc29Q80VM3 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ttc29Q80VM3 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ttc29Q80VM3 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ttc29Q80VM3 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ttc29Q80VM3 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ttc29Q80VM3 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Ttc29Q80VM3 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Ttc29Q80VM3 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ttc29Q80VM3 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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