Protein–RNA interactions for Protein: Q80TM9

Nisch, Nischarin, mousemouse

Predictions only

Length 1,593 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NischQ80TM9 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
NischQ80TM9 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
NischQ80TM9 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
NischQ80TM9 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
NischQ80TM9 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
NischQ80TM9 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
NischQ80TM9 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
NischQ80TM9 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
NischQ80TM9 Gm14235-201ENSMUST00000142445 366 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
NischQ80TM9 Gm18734-201ENSMUST00000172937 808 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
NischQ80TM9 Gm7467-201ENSMUST00000185173 652 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
NischQ80TM9 Gm9555-201ENSMUST00000200908 583 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
NischQ80TM9 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
NischQ80TM9 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
NischQ80TM9 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
NischQ80TM9 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
NischQ80TM9 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
NischQ80TM9 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
NischQ80TM9 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
NischQ80TM9 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
NischQ80TM9 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
NischQ80TM9 Dynlrb1-202ENSMUST00000109682 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
NischQ80TM9 Lamr1-ps1-201ENSMUST00000119759 874 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
NischQ80TM9 Gm27552-201ENSMUST00000183351 62 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
NischQ80TM9 Gm27844-201ENSMUST00000183613 62 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
NischQ80TM9 Rprl1-202ENSMUST00000198476 238 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
NischQ80TM9 Gm18393-201ENSMUST00000208349 1131 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
NischQ80TM9 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
NischQ80TM9 Rpl17-ps3-201ENSMUST00000221295 556 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
NischQ80TM9 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
NischQ80TM9 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
NischQ80TM9 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
NischQ80TM9 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
NischQ80TM9 Cacng1-201ENSMUST00000021065 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
NischQ80TM9 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
NischQ80TM9 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
NischQ80TM9 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
NischQ80TM9 Gm45495-201ENSMUST00000200940 1700 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
NischQ80TM9 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
NischQ80TM9 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2
NischQ80TM9 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2
NischQ80TM9 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NischQ80TM9 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NischQ80TM9 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NischQ80TM9 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NischQ80TM9 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NischQ80TM9 Zar1l-201ENSMUST00000118769 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NischQ80TM9 Gm13461-201ENSMUST00000120980 662 ntBASIC27.57■■■□□ 2
NischQ80TM9 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC27.57■■■□□ 2
NischQ80TM9 1700003G13Rik-202ENSMUST00000131342 705 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NischQ80TM9 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC27.57■■■□□ 2
NischQ80TM9 Gm43050-201ENSMUST00000201062 338 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
NischQ80TM9 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
NischQ80TM9 Olfr398-201ENSMUST00000053874 945 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
NischQ80TM9 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
NischQ80TM9 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NischQ80TM9 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
NischQ80TM9 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NischQ80TM9 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NischQ80TM9 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NischQ80TM9 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NischQ80TM9 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NischQ80TM9 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NischQ80TM9 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NischQ80TM9 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NischQ80TM9 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NischQ80TM9 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
NischQ80TM9 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
NischQ80TM9 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
NischQ80TM9 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC27.56■■■□□ 2
NischQ80TM9 Saa2-202ENSMUST00000210272 511 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
NischQ80TM9 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
NischQ80TM9 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
NischQ80TM9 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
NischQ80TM9 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
NischQ80TM9 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
NischQ80TM9 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
NischQ80TM9 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
NischQ80TM9 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
NischQ80TM9 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
NischQ80TM9 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
NischQ80TM9 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
NischQ80TM9 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
NischQ80TM9 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
NischQ80TM9 Gm28982-201ENSMUST00000186895 512 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
NischQ80TM9 Gm38804-201ENSMUST00000203998 767 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
NischQ80TM9 Gm10109-202ENSMUST00000206890 1211 ntBASIC27.56■■■□□ 2
NischQ80TM9 Gm10109-201ENSMUST00000072123 1078 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
NischQ80TM9 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
NischQ80TM9 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
NischQ80TM9 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NischQ80TM9 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NischQ80TM9 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NischQ80TM9 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NischQ80TM9 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
NischQ80TM9 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NischQ80TM9 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
NischQ80TM9 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NischQ80TM9 Taf6l-202ENSMUST00000010249 848 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NischQ80TM9 Zfp157-203ENSMUST00000110912 886 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
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