Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSQ1

Clec18a, C-type lectin domain family 18 member A, mousemouse

Predictions only

Length 534 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clec18aQ7TSQ1 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Clec18aQ7TSQ1 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Clec18aQ7TSQ1 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Clec18aQ7TSQ1 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Clec18aQ7TSQ1 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Clec18aQ7TSQ1 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Clec18aQ7TSQ1 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Clec18aQ7TSQ1 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Clec18aQ7TSQ1 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Clec18aQ7TSQ1 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Clec18aQ7TSQ1 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Clec18aQ7TSQ1 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Clec18aQ7TSQ1 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Clec18aQ7TSQ1 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Clec18aQ7TSQ1 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Clec18aQ7TSQ1 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Clec18aQ7TSQ1 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Clec18aQ7TSQ1 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Clec18aQ7TSQ1 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Clec18aQ7TSQ1 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Clec18aQ7TSQ1 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Clec18aQ7TSQ1 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Clec18aQ7TSQ1 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Clec18aQ7TSQ1 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Clec18aQ7TSQ1 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Clec18aQ7TSQ1 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Clec18aQ7TSQ1 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Clec18aQ7TSQ1 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Clec18aQ7TSQ1 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Clec18aQ7TSQ1 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Clec18aQ7TSQ1 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Clec18aQ7TSQ1 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Clec18aQ7TSQ1 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Clec18aQ7TSQ1 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Clec18aQ7TSQ1 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Clec18aQ7TSQ1 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Clec18aQ7TSQ1 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Clec18aQ7TSQ1 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Clec18aQ7TSQ1 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Clec18aQ7TSQ1 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Clec18aQ7TSQ1 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Clec18aQ7TSQ1 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Clec18aQ7TSQ1 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Clec18aQ7TSQ1 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Clec18aQ7TSQ1 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Clec18aQ7TSQ1 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Clec18aQ7TSQ1 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Clec18aQ7TSQ1 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Clec18aQ7TSQ1 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Clec18aQ7TSQ1 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Clec18aQ7TSQ1 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Clec18aQ7TSQ1 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Clec18aQ7TSQ1 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Clec18aQ7TSQ1 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Clec18aQ7TSQ1 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Clec18aQ7TSQ1 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Clec18aQ7TSQ1 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Clec18aQ7TSQ1 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Clec18aQ7TSQ1 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Clec18aQ7TSQ1 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Clec18aQ7TSQ1 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Clec18aQ7TSQ1 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Clec18aQ7TSQ1 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Clec18aQ7TSQ1 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Clec18aQ7TSQ1 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Clec18aQ7TSQ1 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Clec18aQ7TSQ1 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Clec18aQ7TSQ1 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Clec18aQ7TSQ1 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Clec18aQ7TSQ1 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Clec18aQ7TSQ1 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Clec18aQ7TSQ1 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Clec18aQ7TSQ1 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Clec18aQ7TSQ1 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Clec18aQ7TSQ1 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Clec18aQ7TSQ1 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Clec18aQ7TSQ1 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Clec18aQ7TSQ1 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Clec18aQ7TSQ1 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Clec18aQ7TSQ1 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Clec18aQ7TSQ1 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Clec18aQ7TSQ1 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Clec18aQ7TSQ1 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Clec18aQ7TSQ1 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Clec18aQ7TSQ1 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Clec18aQ7TSQ1 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Clec18aQ7TSQ1 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Clec18aQ7TSQ1 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Clec18aQ7TSQ1 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Clec18aQ7TSQ1 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Clec18aQ7TSQ1 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Clec18aQ7TSQ1 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Clec18aQ7TSQ1 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Clec18aQ7TSQ1 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Clec18aQ7TSQ1 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Clec18aQ7TSQ1 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Clec18aQ7TSQ1 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Clec18aQ7TSQ1 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Clec18aQ7TSQ1 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Clec18aQ7TSQ1 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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