Protein–RNA interactions for Protein: Q7M729

Scn4b, Sodium channel subunit beta-4, mousemouse

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn4bQ7M729 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Scn4bQ7M729 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Scn4bQ7M729 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Scn4bQ7M729 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Scn4bQ7M729 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Scn4bQ7M729 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Scn4bQ7M729 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Scn4bQ7M729 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Scn4bQ7M729 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Scn4bQ7M729 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Scn4bQ7M729 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Scn4bQ7M729 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Scn4bQ7M729 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Scn4bQ7M729 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Scn4bQ7M729 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Scn4bQ7M729 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Scn4bQ7M729 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Scn4bQ7M729 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Scn4bQ7M729 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Scn4bQ7M729 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Scn4bQ7M729 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Scn4bQ7M729 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Scn4bQ7M729 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Scn4bQ7M729 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Scn4bQ7M729 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Scn4bQ7M729 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Scn4bQ7M729 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Scn4bQ7M729 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Scn4bQ7M729 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Scn4bQ7M729 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Scn4bQ7M729 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Scn4bQ7M729 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Scn4bQ7M729 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Scn4bQ7M729 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Scn4bQ7M729 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Scn4bQ7M729 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Scn4bQ7M729 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Scn4bQ7M729 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Scn4bQ7M729 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Scn4bQ7M729 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Scn4bQ7M729 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Scn4bQ7M729 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Scn4bQ7M729 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Scn4bQ7M729 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Scn4bQ7M729 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Scn4bQ7M729 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Scn4bQ7M729 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Scn4bQ7M729 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Scn4bQ7M729 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Scn4bQ7M729 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Scn4bQ7M729 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Scn4bQ7M729 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Scn4bQ7M729 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Scn4bQ7M729 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Scn4bQ7M729 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Scn4bQ7M729 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Scn4bQ7M729 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Scn4bQ7M729 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Scn4bQ7M729 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Scn4bQ7M729 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Scn4bQ7M729 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Scn4bQ7M729 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Scn4bQ7M729 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Scn4bQ7M729 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Scn4bQ7M729 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Scn4bQ7M729 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Scn4bQ7M729 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Scn4bQ7M729 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Scn4bQ7M729 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Scn4bQ7M729 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Scn4bQ7M729 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Scn4bQ7M729 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Scn4bQ7M729 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Scn4bQ7M729 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Scn4bQ7M729 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Scn4bQ7M729 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Scn4bQ7M729 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Scn4bQ7M729 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Scn4bQ7M729 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Scn4bQ7M729 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Scn4bQ7M729 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Scn4bQ7M729 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Scn4bQ7M729 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Scn4bQ7M729 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Scn4bQ7M729 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Scn4bQ7M729 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Scn4bQ7M729 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Scn4bQ7M729 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Scn4bQ7M729 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Scn4bQ7M729 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Scn4bQ7M729 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Scn4bQ7M729 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Scn4bQ7M729 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Scn4bQ7M729 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Scn4bQ7M729 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Scn4bQ7M729 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Scn4bQ7M729 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Scn4bQ7M729 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Scn4bQ7M729 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Scn4bQ7M729 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
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