Protein–RNA interactions for Protein: Q76I25

Higd1c, HIG1 domain family member 1C, mousemouse

Predictions only

Length 96 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Higd1cQ76I25 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Higd1cQ76I25 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Higd1cQ76I25 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Higd1cQ76I25 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Higd1cQ76I25 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Higd1cQ76I25 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Higd1cQ76I25 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Higd1cQ76I25 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Higd1cQ76I25 Fn1-216ENSMUST00000189821 7410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Higd1cQ76I25 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Higd1cQ76I25 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Higd1cQ76I25 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Higd1cQ76I25 Pfas-201ENSMUST00000021282 6373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Higd1cQ76I25 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Higd1cQ76I25 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Higd1cQ76I25 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Higd1cQ76I25 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Higd1cQ76I25 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Higd1cQ76I25 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Higd1cQ76I25 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Higd1cQ76I25 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Higd1cQ76I25 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Higd1cQ76I25 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Higd1cQ76I25 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Higd1cQ76I25 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Higd1cQ76I25 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Higd1cQ76I25 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Higd1cQ76I25 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Higd1cQ76I25 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Higd1cQ76I25 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Higd1cQ76I25 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Higd1cQ76I25 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Higd1cQ76I25 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Higd1cQ76I25 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Higd1cQ76I25 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Higd1cQ76I25 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Higd1cQ76I25 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Higd1cQ76I25 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Higd1cQ76I25 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Higd1cQ76I25 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Higd1cQ76I25 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Higd1cQ76I25 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Higd1cQ76I25 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Higd1cQ76I25 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Higd1cQ76I25 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Higd1cQ76I25 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Higd1cQ76I25 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Higd1cQ76I25 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Higd1cQ76I25 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Higd1cQ76I25 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Higd1cQ76I25 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Higd1cQ76I25 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Higd1cQ76I25 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Higd1cQ76I25 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Higd1cQ76I25 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Higd1cQ76I25 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Higd1cQ76I25 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Higd1cQ76I25 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Higd1cQ76I25 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Higd1cQ76I25 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Higd1cQ76I25 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Higd1cQ76I25 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Higd1cQ76I25 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Higd1cQ76I25 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Higd1cQ76I25 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Higd1cQ76I25 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Higd1cQ76I25 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Higd1cQ76I25 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Higd1cQ76I25 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Higd1cQ76I25 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Higd1cQ76I25 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Higd1cQ76I25 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Higd1cQ76I25 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Higd1cQ76I25 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Higd1cQ76I25 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Higd1cQ76I25 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Higd1cQ76I25 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Higd1cQ76I25 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Higd1cQ76I25 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Higd1cQ76I25 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Higd1cQ76I25 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Higd1cQ76I25 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Higd1cQ76I25 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Higd1cQ76I25 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Higd1cQ76I25 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Higd1cQ76I25 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Higd1cQ76I25 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Higd1cQ76I25 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Higd1cQ76I25 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Higd1cQ76I25 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Higd1cQ76I25 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Higd1cQ76I25 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Higd1cQ76I25 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Higd1cQ76I25 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Higd1cQ76I25 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Higd1cQ76I25 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Higd1cQ76I25 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Higd1cQ76I25 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Higd1cQ76I25 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Higd1cQ76I25 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms