Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9N8

Trak2, Trafficking protein, kinesin-binding 2, mousemouse

Predictions only

Length 913 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trak2Q6P9N8 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trak2Q6P9N8 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trak2Q6P9N8 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trak2Q6P9N8 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trak2Q6P9N8 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trak2Q6P9N8 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trak2Q6P9N8 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trak2Q6P9N8 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trak2Q6P9N8 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trak2Q6P9N8 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trak2Q6P9N8 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trak2Q6P9N8 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trak2Q6P9N8 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trak2Q6P9N8 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trak2Q6P9N8 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trak2Q6P9N8 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trak2Q6P9N8 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trak2Q6P9N8 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trak2Q6P9N8 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Trak2Q6P9N8 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Trak2Q6P9N8 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Trak2Q6P9N8 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Trak2Q6P9N8 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trak2Q6P9N8 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trak2Q6P9N8 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trak2Q6P9N8 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trak2Q6P9N8 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trak2Q6P9N8 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trak2Q6P9N8 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trak2Q6P9N8 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trak2Q6P9N8 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trak2Q6P9N8 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trak2Q6P9N8 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trak2Q6P9N8 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Trak2Q6P9N8 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trak2Q6P9N8 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trak2Q6P9N8 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trak2Q6P9N8 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trak2Q6P9N8 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trak2Q6P9N8 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trak2Q6P9N8 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trak2Q6P9N8 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trak2Q6P9N8 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trak2Q6P9N8 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trak2Q6P9N8 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trak2Q6P9N8 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trak2Q6P9N8 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trak2Q6P9N8 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trak2Q6P9N8 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trak2Q6P9N8 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Trak2Q6P9N8 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Trak2Q6P9N8 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trak2Q6P9N8 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trak2Q6P9N8 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trak2Q6P9N8 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trak2Q6P9N8 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trak2Q6P9N8 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trak2Q6P9N8 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trak2Q6P9N8 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trak2Q6P9N8 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trak2Q6P9N8 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trak2Q6P9N8 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trak2Q6P9N8 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trak2Q6P9N8 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trak2Q6P9N8 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trak2Q6P9N8 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trak2Q6P9N8 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trak2Q6P9N8 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trak2Q6P9N8 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trak2Q6P9N8 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trak2Q6P9N8 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trak2Q6P9N8 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trak2Q6P9N8 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trak2Q6P9N8 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trak2Q6P9N8 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trak2Q6P9N8 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trak2Q6P9N8 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trak2Q6P9N8 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trak2Q6P9N8 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trak2Q6P9N8 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trak2Q6P9N8 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trak2Q6P9N8 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trak2Q6P9N8 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trak2Q6P9N8 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trak2Q6P9N8 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trak2Q6P9N8 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trak2Q6P9N8 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trak2Q6P9N8 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trak2Q6P9N8 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trak2Q6P9N8 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trak2Q6P9N8 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Trak2Q6P9N8 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Trak2Q6P9N8 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trak2Q6P9N8 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trak2Q6P9N8 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trak2Q6P9N8 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trak2Q6P9N8 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trak2Q6P9N8 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trak2Q6P9N8 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trak2Q6P9N8 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms