Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU5

Cltb, Clathrin light chain B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CltbQ6IRU5 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
CltbQ6IRU5 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
CltbQ6IRU5 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
CltbQ6IRU5 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
CltbQ6IRU5 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
CltbQ6IRU5 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
CltbQ6IRU5 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
CltbQ6IRU5 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
CltbQ6IRU5 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
CltbQ6IRU5 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
CltbQ6IRU5 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
CltbQ6IRU5 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
CltbQ6IRU5 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
CltbQ6IRU5 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
CltbQ6IRU5 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
CltbQ6IRU5 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC12.5□□□□□ -0.41
CltbQ6IRU5 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC12.5□□□□□ -0.41
CltbQ6IRU5 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
CltbQ6IRU5 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
CltbQ6IRU5 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
CltbQ6IRU5 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC12.5□□□□□ -0.41
CltbQ6IRU5 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
CltbQ6IRU5 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
CltbQ6IRU5 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
CltbQ6IRU5 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
CltbQ6IRU5 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
CltbQ6IRU5 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
CltbQ6IRU5 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
CltbQ6IRU5 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
CltbQ6IRU5 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
CltbQ6IRU5 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
CltbQ6IRU5 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
CltbQ6IRU5 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
CltbQ6IRU5 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
CltbQ6IRU5 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
CltbQ6IRU5 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
CltbQ6IRU5 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
CltbQ6IRU5 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
CltbQ6IRU5 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
CltbQ6IRU5 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
CltbQ6IRU5 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
CltbQ6IRU5 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
CltbQ6IRU5 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
CltbQ6IRU5 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
CltbQ6IRU5 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
CltbQ6IRU5 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
CltbQ6IRU5 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
CltbQ6IRU5 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
CltbQ6IRU5 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
CltbQ6IRU5 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
CltbQ6IRU5 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
CltbQ6IRU5 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
CltbQ6IRU5 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
CltbQ6IRU5 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
CltbQ6IRU5 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
CltbQ6IRU5 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
CltbQ6IRU5 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
CltbQ6IRU5 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC12.49□□□□□ -0.41
CltbQ6IRU5 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
CltbQ6IRU5 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
CltbQ6IRU5 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
CltbQ6IRU5 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC12.49□□□□□ -0.41
CltbQ6IRU5 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC12.49□□□□□ -0.41
CltbQ6IRU5 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
CltbQ6IRU5 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
CltbQ6IRU5 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
CltbQ6IRU5 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
CltbQ6IRU5 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
CltbQ6IRU5 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
CltbQ6IRU5 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
CltbQ6IRU5 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
CltbQ6IRU5 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
CltbQ6IRU5 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
CltbQ6IRU5 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
CltbQ6IRU5 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
CltbQ6IRU5 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
CltbQ6IRU5 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
CltbQ6IRU5 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
CltbQ6IRU5 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
CltbQ6IRU5 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
CltbQ6IRU5 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
CltbQ6IRU5 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
CltbQ6IRU5 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
CltbQ6IRU5 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
CltbQ6IRU5 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
CltbQ6IRU5 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
CltbQ6IRU5 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
CltbQ6IRU5 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
CltbQ6IRU5 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
CltbQ6IRU5 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
CltbQ6IRU5 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
CltbQ6IRU5 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
CltbQ6IRU5 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
CltbQ6IRU5 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
CltbQ6IRU5 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
CltbQ6IRU5 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
CltbQ6IRU5 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
CltbQ6IRU5 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
CltbQ6IRU5 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
CltbQ6IRU5 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.8 ms