Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZB0

Lrrcc1, Leucine-rich repeat and coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,026 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrcc1Q69ZB0 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lrrcc1Q69ZB0 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lrrcc1Q69ZB0 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lrrcc1Q69ZB0 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lrrcc1Q69ZB0 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lrrcc1Q69ZB0 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lrrcc1Q69ZB0 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lrrcc1Q69ZB0 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrrcc1Q69ZB0 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrrcc1Q69ZB0 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrrcc1Q69ZB0 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrrcc1Q69ZB0 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrrcc1Q69ZB0 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrrcc1Q69ZB0 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrrcc1Q69ZB0 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrrcc1Q69ZB0 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrrcc1Q69ZB0 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrrcc1Q69ZB0 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrrcc1Q69ZB0 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrrcc1Q69ZB0 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrrcc1Q69ZB0 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrrcc1Q69ZB0 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrrcc1Q69ZB0 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrrcc1Q69ZB0 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrrcc1Q69ZB0 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrrcc1Q69ZB0 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrrcc1Q69ZB0 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrrcc1Q69ZB0 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrrcc1Q69ZB0 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrrcc1Q69ZB0 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrrcc1Q69ZB0 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrrcc1Q69ZB0 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrrcc1Q69ZB0 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrrcc1Q69ZB0 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrrcc1Q69ZB0 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrrcc1Q69ZB0 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrrcc1Q69ZB0 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrrcc1Q69ZB0 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrrcc1Q69ZB0 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrrcc1Q69ZB0 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrrcc1Q69ZB0 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrrcc1Q69ZB0 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrrcc1Q69ZB0 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrrcc1Q69ZB0 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrrcc1Q69ZB0 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrrcc1Q69ZB0 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrrcc1Q69ZB0 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrrcc1Q69ZB0 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrrcc1Q69ZB0 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrrcc1Q69ZB0 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrrcc1Q69ZB0 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrrcc1Q69ZB0 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrrcc1Q69ZB0 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrrcc1Q69ZB0 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrrcc1Q69ZB0 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrrcc1Q69ZB0 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrrcc1Q69ZB0 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrrcc1Q69ZB0 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrrcc1Q69ZB0 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrrcc1Q69ZB0 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrrcc1Q69ZB0 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrrcc1Q69ZB0 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrrcc1Q69ZB0 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrrcc1Q69ZB0 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrrcc1Q69ZB0 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrrcc1Q69ZB0 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrrcc1Q69ZB0 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrrcc1Q69ZB0 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lrrcc1Q69ZB0 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lrrcc1Q69ZB0 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lrrcc1Q69ZB0 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lrrcc1Q69ZB0 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lrrcc1Q69ZB0 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lrrcc1Q69ZB0 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lrrcc1Q69ZB0 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lrrcc1Q69ZB0 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Lrrcc1Q69ZB0 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lrrcc1Q69ZB0 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lrrcc1Q69ZB0 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lrrcc1Q69ZB0 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lrrcc1Q69ZB0 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lrrcc1Q69ZB0 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lrrcc1Q69ZB0 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Lrrcc1Q69ZB0 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lrrcc1Q69ZB0 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lrrcc1Q69ZB0 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Lrrcc1Q69ZB0 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lrrcc1Q69ZB0 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Lrrcc1Q69ZB0 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Lrrcc1Q69ZB0 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Lrrcc1Q69ZB0 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lrrcc1Q69ZB0 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lrrcc1Q69ZB0 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lrrcc1Q69ZB0 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lrrcc1Q69ZB0 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lrrcc1Q69ZB0 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lrrcc1Q69ZB0 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lrrcc1Q69ZB0 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lrrcc1Q69ZB0 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lrrcc1Q69ZB0 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.9 ms