Protein–RNA interactions for Protein: Q68FH0

Pkp4, Plakophilin-4, mousemouse

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Length 1,190 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp4Q68FH0 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Pkp4Q68FH0 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pkp4Q68FH0 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pkp4Q68FH0 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pkp4Q68FH0 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pkp4Q68FH0 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pkp4Q68FH0 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pkp4Q68FH0 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pkp4Q68FH0 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pkp4Q68FH0 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pkp4Q68FH0 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pkp4Q68FH0 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pkp4Q68FH0 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pkp4Q68FH0 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Pkp4Q68FH0 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pkp4Q68FH0 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pkp4Q68FH0 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Pkp4Q68FH0 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
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Pkp4Q68FH0 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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Pkp4Q68FH0 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pkp4Q68FH0 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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Pkp4Q68FH0 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pkp4Q68FH0 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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Pkp4Q68FH0 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pkp4Q68FH0 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pkp4Q68FH0 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pkp4Q68FH0 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pkp4Q68FH0 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pkp4Q68FH0 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pkp4Q68FH0 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pkp4Q68FH0 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pkp4Q68FH0 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pkp4Q68FH0 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pkp4Q68FH0 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pkp4Q68FH0 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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Pkp4Q68FH0 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
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Pkp4Q68FH0 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Pkp4Q68FH0 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Pkp4Q68FH0 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Pkp4Q68FH0 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Pkp4Q68FH0 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Pkp4Q68FH0 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Pkp4Q68FH0 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Pkp4Q68FH0 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
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Pkp4Q68FH0 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Pkp4Q68FH0 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Pkp4Q68FH0 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
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Pkp4Q68FH0 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Pkp4Q68FH0 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Pkp4Q68FH0 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Pkp4Q68FH0 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Pkp4Q68FH0 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Pkp4Q68FH0 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Pkp4Q68FH0 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Pkp4Q68FH0 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Pkp4Q68FH0 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Pkp4Q68FH0 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Pkp4Q68FH0 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Pkp4Q68FH0 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Pkp4Q68FH0 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Pkp4Q68FH0 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Pkp4Q68FH0 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Pkp4Q68FH0 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Pkp4Q68FH0 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Pkp4Q68FH0 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Pkp4Q68FH0 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Pkp4Q68FH0 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Pkp4Q68FH0 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Pkp4Q68FH0 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Pkp4Q68FH0 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Pkp4Q68FH0 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Pkp4Q68FH0 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
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