Protein–RNA interactions for Protein: Q68FG3

Spty2d1, Protein SPT2 homolog, mousemouse

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Length 682 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spty2d1Q68FG3 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Spty2d1Q68FG3 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Spty2d1Q68FG3 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Spty2d1Q68FG3 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Spty2d1Q68FG3 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Spty2d1Q68FG3 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Spty2d1Q68FG3 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Spty2d1Q68FG3 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Spty2d1Q68FG3 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Spty2d1Q68FG3 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Spty2d1Q68FG3 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Spty2d1Q68FG3 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Spty2d1Q68FG3 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Spty2d1Q68FG3 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Spty2d1Q68FG3 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Spty2d1Q68FG3 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Spty2d1Q68FG3 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Spty2d1Q68FG3 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Spty2d1Q68FG3 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Spty2d1Q68FG3 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Spty2d1Q68FG3 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Spty2d1Q68FG3 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Spty2d1Q68FG3 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Spty2d1Q68FG3 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Spty2d1Q68FG3 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Spty2d1Q68FG3 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Spty2d1Q68FG3 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Spty2d1Q68FG3 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Spty2d1Q68FG3 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Spty2d1Q68FG3 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Spty2d1Q68FG3 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Spty2d1Q68FG3 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Spty2d1Q68FG3 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Spty2d1Q68FG3 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Spty2d1Q68FG3 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Spty2d1Q68FG3 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Spty2d1Q68FG3 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Spty2d1Q68FG3 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Spty2d1Q68FG3 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Spty2d1Q68FG3 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Spty2d1Q68FG3 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Spty2d1Q68FG3 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Spty2d1Q68FG3 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Spty2d1Q68FG3 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Spty2d1Q68FG3 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Spty2d1Q68FG3 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Spty2d1Q68FG3 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Spty2d1Q68FG3 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Spty2d1Q68FG3 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Spty2d1Q68FG3 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Spty2d1Q68FG3 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Spty2d1Q68FG3 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Spty2d1Q68FG3 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Spty2d1Q68FG3 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Spty2d1Q68FG3 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Spty2d1Q68FG3 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Spty2d1Q68FG3 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Spty2d1Q68FG3 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Spty2d1Q68FG3 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Spty2d1Q68FG3 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Spty2d1Q68FG3 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Spty2d1Q68FG3 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Spty2d1Q68FG3 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Spty2d1Q68FG3 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Spty2d1Q68FG3 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Spty2d1Q68FG3 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Spty2d1Q68FG3 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Spty2d1Q68FG3 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Spty2d1Q68FG3 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Spty2d1Q68FG3 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Spty2d1Q68FG3 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Spty2d1Q68FG3 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Spty2d1Q68FG3 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Spty2d1Q68FG3 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Spty2d1Q68FG3 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Spty2d1Q68FG3 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Spty2d1Q68FG3 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Spty2d1Q68FG3 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Spty2d1Q68FG3 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Spty2d1Q68FG3 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Spty2d1Q68FG3 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Spty2d1Q68FG3 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Spty2d1Q68FG3 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Spty2d1Q68FG3 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Spty2d1Q68FG3 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Spty2d1Q68FG3 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Spty2d1Q68FG3 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Spty2d1Q68FG3 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Spty2d1Q68FG3 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Spty2d1Q68FG3 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Spty2d1Q68FG3 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Spty2d1Q68FG3 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Spty2d1Q68FG3 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Spty2d1Q68FG3 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Spty2d1Q68FG3 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Spty2d1Q68FG3 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Spty2d1Q68FG3 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Spty2d1Q68FG3 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Spty2d1Q68FG3 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Spty2d1Q68FG3 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.2 ms